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t*******a
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1
四万年前北京人DNA成功提取测序:第一个中国古人类基因组
澎湃新闻记者 吴跃伟
2017-10-13 08:08 来源:澎湃新闻
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田园洞遗址外观图 受访者供图
零落成泥碾作尘,只有香如故。
数万年前古人类的基因组也可以从化石中提取出来,也可以测序?
国际上最新的古DNA技术,让数万年甚至几十万年前古人类的DNA从人类化石甚至土壤中
获得,成为一种可能。
北京房山的田园洞曾出土一具四万年前男性的骨骼化石。中国科学院古脊椎动物与古人
类研究所的研究人员从其富含细菌和真菌DNA污染的化石样品中,通过他们和德国合作
团队一同开发的一种特殊的捕获技术,将混杂在大量微生物DNA中极其微量的古人类的
DNA筛选出来,并进行了测序。
由此,中国地区古人类的第一个基因组、整个东亚地区最古老的人类基因组诞生。
科学家们对这一难得的基因组数据进行了充分研究,他们将其与世界范围内各种人群的
基因组数据等进行了比对。研究最终证实,田园洞人属于古东亚人,但他并非现代东亚
人的直接祖先。也就是说,田园洞人这一支系的东亚人没能繁衍至今。
科学家惊讶地发现,四万年前,虽然田园洞人居住在中国北京房山地区,他们却跟来... 阅读全帖
d*********o
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2
http://www.cbc.ca/news/canada/british-columbia/seattle-man-arrested-in-connection-with-1987-slayings-of-b-c-high-school-sweethearts-1.4669139
_gen/derivatives/original_780/cook-van-cuylenborg-cold-case.jpg
Tanya Van Cuylenborg, 18, and her boyfriend, Jay Cook, 20, vanished Nov. 18,
1987, while they were on a road trip from Saanich, B.C., to Seattle, in
this bronze 1977 Ford Club van. Their bodies were found days later in
Western Washington, about 65 miles apart. (Snohomish County Sheriff’s
Offic... 阅读全帖
t**t
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3
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: askquestion (ask), 信区: Biology
标 题: ZZ: 复旦公布曹操家族DNA:非夏侯氏抱养 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 11 11:30:05 2013, 美东)
发信人: bouy (BB), 信区: History
标 题: ZZ: 复旦公布曹操家族DNA:非夏侯氏抱养
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 11 09:47:18 2013, 美东)
大家說說這個研究有什麼意義?曹操爺爺都發現了,現在證明『曹操墓』裏的骨頭是曹
操了嗎?
http://news.163.com/13/1111/15/9DDLAFN00001124J.html
【新民网·独家报道】由于家族基因间没有关系,“曹操是汉代丞相曹参后人”这一说
法有误;而现有的夏侯氏基因与曹操家族基因也不一致,因此曹操从夏侯氏抱养的说法
也不准确。新民网记者今天(11日)获悉,复旦大学课题组宣布完全确定曹操家族DNA,
围绕曹操及其家族的身世、遗传之迷也随之逐步破解。
曹操身世之迷:既非曹参后代亦非... 阅读全帖
a****a
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4
合肥 个摊点仅两成真货
DNA
66
夏天到了,傍晚,到大排档、路边摊,烤上几串羊肉串,再来瓶啤酒,想必是不少
人,在夏天最喜欢选择的一种解暑休闲方式。然而最近,安徽大学学生薛纯,通过DNA检
测的方式,对合肥66个摊点的肉串进行了肉类成分检测,结果出乎意料,在采集的66个
样品中羊肉只占大约两成。
A
测试肉串成了
毕业论文内容
安徽大学2009级生物科学专业大四毕业生薛纯是一名动物爱好者,他一直担心一些
无良商家会捕杀流浪动物来降低烤肉串成本。
薛纯告诉记者,他是学校动物保护协会的一名会员,看到有新闻报道说广东有捕流
浪猫狗用作羊肉串,就想看看羊肉串里有没有这些肉。经过和论文指导老师协商,薛纯
决定测试烤肉串里肉的种类作为自己的毕业论文研究方向。
薛纯说,后来和指导老师商量一下,觉得肉串里有这些流浪猫的肉,可能性不是很
大,因为分析了一下那些肉的货源不是很稳定,没有一个充分的货源供给,最后实验结
果也证明了这一点。
想法一决定,薛纯便开始了实施的过程。他用了两个月的时间,足迹踏遍了合肥四
个主城区,从合肥66个摊点买了66串烤肉串回来作为样本。
B
检测确认
各种肉的种类
接着,薛... 阅读全帖
R*****d
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5
先回答你的问题。
>BTW,你的高加索(白种人)血统是哪里来的?
你到底认真读了这篇文章没有? 该文在第三段(总第五行)就明确宣称:"Now DNA testing
of the villagers has shown that almost two thirds ofthem are of Caucasian origin".
>你的年份有是咋算的?
请认真读一遍我的回贴再提这个问题:
按照《汉书》记载,陈汤攻杀郅支单于是公元前36年的事。而罗马吞并埃及则是公元前
30年的事(就在这一年,伊丽莎白泰勒自杀--噢,不对,应该是克里奥珀特拉女王)。
后者比前者晚了六年。所以,在陈汤同所谓“罗马士兵”作战的时候,亚历山得里亚(
骊靬)还不是罗马共和国的一部分。因此,即便陈汤的确俘虏了一些罗马士兵并将他们
带回汉朝安置,这些人也显然不会以“骊靬”自称(如果把他们认为是克拉苏东征军团
的残部的话,他们早在公元前53年就以失去了同母国(罗马)之间的联系,又怎么可能预
见到若干年后“骊靬”会成为罗马的领土呢),安置他们的汉朝政府同样也不应该用“
骊靬”这个词来指代这些人的母国,从而用其来命名这个为... 阅读全帖
f**u
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6
我特意去看了看NASA发布会的直播,对于是不是adaptive evolution,大家还有疑问。
有个提问比较专业,问那个作者在进化上As是什么时候取代P的,作者答曰不知。
还有人说可能在RNA世界的时候分别有两套生命系统,一套用P,一套用As,
不过这个好像不是很靠普的样子。
嘉宾里还有个化学家,也是NASA的astrobiology大团队的一部分,
他还不是特别的convinced,他说从化学上说As太过活跃,如果完全是As作为DNA骨架,
那么这个骨架是很容易断裂的,除非这个菌有很强大的DNA修复能力,
但即便如此细菌去修复这些断裂也要花掉很多能量,他觉得不可思议。
另外一种解释是有其他的东西比如说蛋白什么的来stabilize DNA的骨架,
但是他说你在提DNA的时候蛋白都会被除掉,文章作者说胶上的DNA的确有断裂,
但化学家觉得DNA的断裂不够多,从化学上他不太相信完全是As的骨架只有这么点断裂。
但是他说,As过于活跃是在常温下,但是他觉得如果是在某些超低温的情况下,
比如他说了一个不知道是木卫几还是土卫几的单词,我天文方面词汇量有限,
只知道好像是某个大行星的卫星,具... 阅读全帖
t******y
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7
外源DNA片段是否可能被人体吸收这个结论是肯定的。有些人假设人的消化系统是100%
发挥功能,食物中的DNA会被消化道降解,实际情况远非如此,仔细观察你们的排泄物
构成,其实有大量的食物没有被充分消化,更何况有很高比例消化道功能不全的人群,
他们或者不能分泌足够的胃酸,或者消化道有破损出血,对这些人来说,体细胞接触外
来DNA的机会非常高。
人体细胞接触外来DNA的机会非常高,DNA进入细胞的方式也多种多样,细胞融合,病毒
携带等等。这些DNA整合到人类基因组的可能性也不低。很多癌症的发生与病毒感染,
包括病毒DNA整合直接相关。不过,尽管人类整合外来DNA的概率不低,但是要成为
遗传性改变的概率却非常低。因为通过消化道的外来DNA很难整合到生殖细胞的DNA上去
。当然也不排除有些病毒专门感染生殖细胞,从而提高外来基因的整合效率。
让我奇怪的是那么多学习生物的phD们,做实验做傻了吗?为什么会认为外来DNA不会通
过消化道整合到人的基因组上。整个生态系统的建立就是通过遗传信息的交流之上。原
始真核生物能够把原始线粒体整合到个体中去,DNA整合是一个时刻都在发生的现象。
w********h
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8
来自主题: Macromolecules版 - DNA is directly photographed for the first time
Italian physics professor Enzo Di Fabrizio captures twisted ladder that
props up life
DNA's double-helix structure is on display for the first time in this
electron microscope photograph of a small bundle of DNA strands.
Fifty-nine years after James Watson and Francis Crick deduced the double-
helix structure of DNA, a scientist has captured the first direct photograph
of the twisted ladder that props up life.
Enzo Di Fabrizio, a physics professor at Magna Graecia University in
Catanzaro, Italy,... 阅读全帖
i*****s
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9
在美国纽约街头穿梭的流动DNA实验室,车上用红字写上“DNA测试”,同时还写着标语
“谁是你亲爹?”
纽约街头现流动DNA检测车
法律上常见到要确认直系亲属的血缘关系必须比对DNA(脱氧核糖核酸),这些复
杂的检验大多在专业实验室中进行。现在美国商人看准商机,推出由休旅车改装的流动
实验室,穿梭街头,提供实时的DNA检验。
许多顾客来自美国军方
据美国媒体17日报道,这个特殊的实验室由休旅车改装而成,车上用红字写上“
DNA测试”,同时还写着标语“谁是你亲爹?”这辆流动检验车经常穿梭在纽约街头,
每次收费约299美元到575美元不等,顾客主要是需要鉴别亲子关系的人。检验的结果通
常需要两三天才能出来,顾客可以选择亲自到场聆听,或用邮寄方式得知。
创办者杰瑞德·罗森索搞流动检验车的原因很简单他租不起办公室,同时很有眼球
效应:“人们很爱这种创意,许多人在社交网站上交流分享。”他透露:“类似休旅车
这种密封的环境让人感觉私密,人们会更放松。”特殊的是,这辆车改造后,不仅能检
验DNA,还提供酒精、毒品检验,并与其他地方诊所合作。而为了避免尴尬,且顾及隐
私,还提供额外收费的“临时演员”服务... 阅读全帖
I***i
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10
来自主题: Animals版 - Bigfoot DNA? Not so fast, many say
http://www.latimes.com/news/science/sciencenow/la-sci-sn-sasqua
Bigfoot DNA? Not so fast, many say
http://www.trbimg.com/img-50b54dcc/turbine/la-sci-sn-sasquatch-
A Texas veterinarian-researcher claims to have shown that the elusive
creature known as Bigfootor Sasquatch is a human hybrid, descended from
human females who mated with males of “an unknown hominin species.” In a
statement released on Saturday, Melba S. Ketchum said that her conclusions
emerged after she sequenced samples of purport... 阅读全帖
h*i
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11
来自主题: History版 - 从Y-DNA看东亚人类的历史
我们说的都是Y-DNA,也就是传男不传女那种DNA. 人有46条DNA, Y-DNA算最小的一条,
里面没有多少基因,管不了多少事的。
所以相貌和Y-DNA的直接关系很弱。芬兰人金发碧眼是N,大部分劳模长的不像白人,但
有白人的Y-DNA, 非洲黑人里面啥Y-DNA都有,等等。所以从个人角度,从相貌看不出Y-
DNA来,要测。
在族群层次,外貌和Y-DNA是相关的,但这种相关是Y-DNA与地理的相关带来的,不是直
接关系。
只算含量高的,大致关系是这这样的:
东亚黄种人:O3, O1, O2, C3 (蒙古), D(日本,西藏)
中东伊朗阿拉伯犹太人:E1b1,J
印度巴基斯坦南亚人:R1a(印欧),H(达罗毗荼), O(汉藏苗瑶)
欧州人:R1b, R1a,I,J,G
美州人:R1b, Q(印第安)
各个国家的人比例不同,反映了他们过去的历史。

o1
t***h
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12
Associated Press, By BRETT ZONGKER August 13, 2015 7:43 PM
WASHINGTON (AP) -- Since the days when George Washington was enamored with
Sally Fairfax, presidents have contended with rumors of extramarital affairs
, but without proof, the shadow of a doubt has worked in their favor.
Then along came DNA testing. DNA testing all but confirmed Thomas Jefferson
slept with his slave Sally Hemings. Now genetic analysis has proved that
President Warren G. Harding fathered a child with long-rumored mistres... 阅读全帖
C****o
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13
人类首次拍摄DNA复制!美科学家:人类理论完全瞎编,中学课本错误百出!
2017-06-21 环球科学大观 基因谷
近日,来自美国加利福尼大学的科学家Stephen博士在顶级杂志《Cell》上发表成果称
,所在团队创奇迹般的摄录了单个DNA分子复制的近距离高清无码影像。事实证明人类
半个多世纪以来“臆想”的模型是何其错误百出,此发现彻底改写我们高中所学的生物
知识,颠覆了整个科学界!
传统观念中,DNA双螺旋结构由4类不同碱基相互交织成链。在遵循碱基互补配对原则、
半保留复制与半不连续复制等规则的条件下,解旋酶、DNA聚合酶与连接酶等物质分别
作用于链状结构,使得新产生的遗传物质与母体完全匹配。

其中最为特征的现象是位于前导链与滞后链上的DNA聚合酶在某种程度上彼此协调,以
避免在解旋时引发突变。
团队的科研人员从大肠杆菌中提取出单个DNA分子并施加着色剂,令科学家震惊的是,
实时镜头显示出真实的DNA在复制过程中,连接酶并不相互协调,而是每条单链高度独
立复制,充满随机性,最后却能够完美与母链相匹配!
在镜头中,时而滞后链停止运行,但前导链继续增长,时而其中一条链突然以10倍正常... 阅读全帖

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14
只要对哲学稍有涉猎,可能下面这句话都耳熟能详:一切确切的知识都属于科学,一切
超乎确切知识之外的,都属于神学。但介乎这两者之间,还有一片受到双方攻击的无人
之域,这就是哲学。这是哲学家罗素的名言,似乎很多哲学书籍里都能看到。从这句话
我们可以知道,科学和神学水火不容,哲学倒像是它们之间的调和剂。但现在,几位科
学家却正在借助科学手段,追溯耶稣或其家人的DNA,希望能为科学和神学做点什么。
即将于4月16日播出的纪录片“耶稣之星”中,参与人类基因组计划的遗传学家与圣经
学者和神学家一起,正从耶稣的家族成员中提取耶稣基督的遗传密码,希望能发现他们
和现代后裔之间的联系。
卡西米尔·波波康斯坦丁诺夫教授是保加利亚中世纪考古学家和历史学家,在保加利亚
科学院考古研究所和大特尔诺沃大学工作。2010年,卡西米尔在保加利亚索佐波尔黑海
东海岸外的一个小岛上,一座六世纪的教堂里发现了一块石板,石板下是一个小小的大
理石盒子,他马上明白了里面是什么——这可能是圣人或宗教人士的遗物。离盒子约一
米远的地方还有一个小盒子,边缘上题着字:“上帝保佑你,仆人托马斯,圣约翰。”
卡西米尔在盒子里发现了5个骨头碎... 阅读全帖
s******a
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15
http://www.36kr.com/p/52483.html
DNAnexus联手Google打造云端DNA数据库,刚刚获得1500万美元投资
DNAnexus是一家致力于打造云端DNA数据库的创业公司,并把这些数据提供给研究人员
和科学家。该公司刚刚在A轮融资中获得1500万美元投资,投资方为Google Ventures和
TPG Biotech。
DNAnexus表示获得Google投资的最大好处就是可以使用Google强大的基础设施,并且可
以从Google员工“20%项目”中获得帮助。
Google将和DNAnexus一道一起打造一个巨大的开放式DNA数据库,用来取代美国政府的
国家生物技术信息中心(NCBI),后者因为政府预算吃紧即将关闭。双方将一起继续为
科研人员免费提供DNA数据库信息。
未来DNAnexus将使用Google的云服务,也是有史以来运行在Google资源上的最大的第三
方服务。
提到公司成立原因,该公司表示是因为每隔18各月建立DNA序列的成本就会便宜十倍。
十年前建立一个人类基因组序列需要30亿美元,而现在你只需要4000美元。有点像是摩
尔定律。... 阅读全帖
b******1
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16
以前学的细胞生物学,微生物学都换给老师了。。。求解答一下概念
1)细菌的菌种鉴定中,“细菌基因组DNA抽取”, 这个DNA是不是指核糖体DNA (rDNA
, Ribosomal DNA)? 还是任何细胞内的DNA?
2)DNA抽取后采用PCR扩增,获得DNA序列 - 16S基因DNA,那这个16S基因DNA是特指
16s rDNA序列?还是只能用16S基因DNA这个笼统的表达方法?
3)扩增的是16s rRNA还是16s rDNA?
a*********n
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【 以下文字转载自 History 讨论区 】
发信人: bouy (BB), 信区: History
标 题: ZZ: 复旦公布曹操家族DNA:非夏侯氏抱养
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 11 09:47:18 2013, 美东)
大家說說這個研究有什麼意義?曹操爺爺都發現了,現在證明『曹操墓』裏的骨頭是曹
操了嗎?
http://news.163.com/13/1111/15/9DDLAFN00001124J.html
【新民网·独家报道】由于家族基因间没有关系,“曹操是汉代丞相曹参后人”这一说
法有误;而现有的夏侯氏基因与曹操家族基因也不一致,因此曹操从夏侯氏抱养的说法
也不准确。新民网记者今天(11日)获悉,复旦大学课题组宣布完全确定曹操家族DNA,
围绕曹操及其家族的身世、遗传之迷也随之逐步破解。
曹操身世之迷:既非曹参后代亦非夏侯氏抱养
2009年,河南安阳对外宣布发现曹操墓,此消息一出即引发轰动,亦引发争议。随后,
复旦大学人类遗传学实验室宣布,拟用DNA技术开展对曹操家族DNA的研究。
曹操本是生活在2000年前的历史人物,寻找他的DNA似乎遥不可及... 阅读全帖
b********g
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18
来自主题: Biology版 - DNA体积不到细胞核的1%
再次强调下,细胞不需要压缩DNA。细胞需要折叠DNA (DNA folding)。
“降低本底表达”指的是这个吗:在无折叠情况下,线性DNA上各基因的表达取决于其
自身的promoter的“强度”,假设其平均表达为100个 (这个就是本底了吗?);折叠
后,所有基因的表达量(率)降低到1-10?
想一想,假设蛋白是单一外显子表达的,约500个AA (这是个平均值);外显子相应的
就含有约1500 bp;每个nuclosome含有DNA 约173bp, linker DNA 约17 bp, 这个
nucleosome + linker DNA 的小单位含有DNA 200 bp, 长度为11 nm + 17*0.34 nm =16
nm。这个蛋白的外显子公约7-8个(nucleosome+liker DNA)单位(简略写为7个),长
度为16*7 = 112 nm; 这个线性DNA 外显子的总长为 1500*0.34 nm = 510 nm。这轮折
叠相当于折叠了5倍。相比把基因表达降低(10-100倍, from 100--->1-10),这个5倍
的折叠似乎不够。 结论,在bead ... 阅读全帖
k***i
发帖数: 662
19
来自主题: ChemEng版 - Bent DNAs Help Probe DNA-Protein Binding
August 9, 2007
BIOCHEMISTRY
Bent DNAs Help Probe DNA-Protein Binding
New class of artificial DNAs could help assess structure-specific DNA recognition
Celia Henry Arnaud
Many DNA-protein interactions involve structural distortions of the DNA helix. A new class of artificial DNAs, called "modular bent DNAs," could help systematically assess the role that DNA bending plays in these interactions, according to a recent study (J. Am. Chem. Soc., DOI: 10.1021/ja071335k).
2′-Deoxyuridylate dimer, n = 1
s***e
发帖数: 911
20
这部分介绍Topoisomerases.
DNA复制时帮助解套的酶叫作 DNA topoisomerases,有两类:
Type I: 剪开一条单链,让另外一条单链通过,然后修复;
type two: 同时剪开双链, 形成一个门, 让DNA上别的部分通过,然后修复.
成熟的关于type II topoisomerase的理论20年前就形成了,叫作two-gate model:
1. enzyme附在DNA上;
2. 剪开DNA双链,形成gate;
3. 当别的DNA segment来时,从这个gate进去, 从enzyme另外一处出来.于是这enzyme
有不同的入口和出口, 称为two-gate model.
以上是被一系列著名实验支持的结论.
具体描述是这样的:
step1: topo II 是一个打开的钳子;
step2 : topo II附着在某DNA的某处,可以想象这剪刀卡在DNA上.此时钳子口
还是打开的,别的DNA segments可以进出;
step3: ATP附着在topo II上,导致钳子关门. 这时候如果已经俘获了另外一条dna
segment,它就出不去了;
s
f****o
发帖数: 8105
21
来自主题: ChinaNews版 - DNA决定寿命 人一出生可知天命
很多人为了长寿也开始了养生,但这似乎与寿命没有太大关系,根据科学的一项研究,
从你出生的时候起,你的DNA就反应了你的寿命。
据英国《每日邮报》日前报导,英国格拉斯哥大学的科学家研究发现,如果排除意外事
故、疾病或不良生活方式的影响,一个人的寿命长短的确在他出生的那一刻就已经被写
进了自己的DNA基因中!
科学家通过测量一些婴儿的基因获得了惊奇的发现,DNA直接决定了人的寿命,端粒的
长短才是决定寿命的重要因素。似乎有人不太了解什么是端粒,而科学家也给出了简单
的解释,端粒就如同鞋带上面的塑料头,保护鞋带。你可以试想一下如果你的鞋带塑料
头坏了将是什么后果。而端粒的作用就是防止染色体受到磨损。
负责这项研究的英国格拉斯哥大学教授帕特.莫纳根称,每个人的寿命长短都跟他小时
候的染色体“端粒”长短有关。端粒是生物染色体末端的一种特殊结构,它是由简单的
DNA高度重复序列组成的,就像DNA的帽子,保护DNA重要遗传信息不丢失。“端粒”越
长的人寿命也就越长;而“端粒”较短的人,寿命就会相对缩短。
这项研究与此前人们的研究大不相同,许多人认为生活习惯的好坏是决定寿命的重要因
素,吸烟酗酒才是短... 阅读全帖
c***s
发帖数: 70028
22
本?拉登,全世界头号恐怖分子,是否真的在美军的突袭行动中被杀死?这个问题自从美国宣布拉登死亡起,便一直被人提及。美国官员之前在多个场合向媒体表示,美国中央情报局的面部识别系统已经确认死者确系本?拉登本人。美国政府官员2日又称,DNA检测显示,有“99.9%”的确定性证实被击毙者是本?拉登本人。
奥巴马左二与美国多名官员观看突袭行动的实时画面,奥巴马面色凝重希拉里捂住嘴。
记者在本?拉登“隐居”的住宅外采访。
疑问1 拉登DNA比对样本来自谁?
美国媒体2日披露了击毙本?拉登过程的一些细节。
据悉,美军先与本?拉登的警卫及其儿子交了火,仅几分钟内两人就丧命了,然后美国特种兵逐个房间地搜索,最终发现了手持武器的拉登,突击队员对准拉登头部开枪,子弹从拉登的左眼射入,将他的头颅打碎。美国官员透露,包括拉登妻子在内的两名妇女受伤。
在突袭过程中,美军一架直升机因“机械故障”坠毁,但没有造成人员伤亡。
美联社报道,本?拉登中弹照片已经送至美国政府,以证明这次行动成功。尚不清楚美国政府是否打算2日公开本?拉登尸体照片。
美方2日回应外界质疑,称将尽一切努力向世界证实本?拉登已死。白宫国土安全及反恐事... 阅读全帖
o***s
发帖数: 42149
23
妻子外遇的证据,可能就藏在一张床单里。徐渊(化名)仔细收好了这张床单,来到长沙寻求DNA鉴定。
或许徐渊并不是为了离婚,或许他还想做出最后的挽留。
但在湖南省第二人民医院芙蓉司法鉴定中心,妻子一巴掌“消灭了”床单上粘着的毛发,还不肯在鉴定委托书上签字和按指纹。
疑点亲眼看到有个男人跳窗而去
徐渊是江西人,2012年的最后一天,他和妻子李梅(化名)驱车近200公里来到长沙,走进了湖南省第二人民医院芙蓉司法鉴定中心。他拎着个塑料袋,里头有条大红色床单。
“我老婆有外遇,这条床单上留了证据。”根据徐渊的说法,李梅和某个男人交往甚密。由于李没有工作,传言说她时不时把男子带回家中。
为了搞清真相,徐渊宁可耽误工作,也会经常从单位跑回家搞“突击检查”。虽然没抓到什么证据,但徐渊还是警告了李梅,要她收敛一些,两人为此争吵不断。
后来,李梅索性搬回了娘家。有人告诉徐渊,那个男人更是明目张胆地和李梅在一起了。
前不久,徐突然去敲了妻子娘家的大门,里头传来男人慌乱的说话声,但门一直紧锁着。
徐渊气得直用脚踹,只听“扑通”一声,有个影子跳窗而出,飞快跑掉了。徐冲进房间,妻子默不作声,问娘家其他人,也没人肯多... 阅读全帖
c***s
发帖数: 70028
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大陆总理李克强17日的记者会一结束,一位大陆记者把李克强座位前的瓶装水抢走,喝了几口还留作纪念,许多同行纷纷仿效,把在场的瓶装水拿走;如果按照美国元首及北韩领导人维安标准,中国高层领导人要小心自己的遗传基因(DNA)落入敌方或有心人士之手。
美国2012年11月版《大西洋月刊》披露,美国政府正在通过驻各国大使馆祕密收集各国政府首脑和联合国高级官员的DNA样本。与此同时,美国特勤局却在尽所有努力防止美国总统欧巴马的DNA被外人获取,只要是美国总统在白宫以外场合用过的床单、水杯或其他用手接触过的物品,都会被消毒或销毁,以防任何人有机会从这些物品中取到美国总统的遗传基因物质。
可以看出,当总理记者会曲终人散,领导人一离场,人民大会堂金色大厅就像没人管一样,当天要是有人想蒐集中国新总理及4位副总理的DNA如探囊取物。至于在前几日的大会,有心人要想收集包括习近平在内7常委的DNA,应该不太困难。若要论领导人维安的警觉性,中国大陆连北韩都不如。
金正日访中 运走大便
韩国《东亚日报》曾引述消息人士的话说︰「北韩为防止洩露金正日的健康状态,在中国停留期间,将金正日的大小便都运回北韩。」看来,已故的金... 阅读全帖
c***s
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夏天到了,傍晚,到大排档、路边摊,烤上几串羊肉串,再来瓶啤酒,想必是不少人,在夏天最喜欢选择的一种解暑休闲方式。然而最近,安徽大学学生薛纯,通过DNA来检测的方式,对合肥66个摊点的肉串进行了肉类成分检测,结果出乎意料,在采集的66个样品中羊肉只占大约两成。
安徽大学2009级生物科学专业大四毕业生薛纯是一名动物爱好者,他担心一些无良商家会捕杀流浪动物来降低烤肉串成本。
薛纯:我是我们学校动物保护协会的一名会员,一直挺关注流浪猫狗保护这一块的,因为我看到有新闻报道说广东有捕流浪猫狗用作羊肉串,我就想看看羊肉串里有没有这些肉。正好我要毕业了吗,正好有这么一个好机会。
经过和论文指导老师协商,薛纯决定测试烤肉串里肉的种类作为自己的毕业论文研究方向。
薛纯:后来和我们指导老师商量一下,觉得肉串里有这些流浪猫的肉,可能性不是很大,因为分析了一下那些肉的货源不是很稳定,没有一个充分的货源供给,最后我的实验结果也证明了这一点。
想法一决定,薛纯便开始了实施的过程。他用了两个月的时间,足迹踏遍了合肥四个主城区,从合肥66个摊点买了66串烤肉串回来做为样本。
薛纯:不管骑自行车或者坐公交,搭朋友的车,... 阅读全帖
b**y
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26
大家說說這個研究有什麼意義?曹操爺爺都發現了,現在證明『曹操墓』裏的骨頭是曹
操了嗎?
http://news.163.com/13/1111/15/9DDLAFN00001124J.html
【新民网·独家报道】由于家族基因间没有关系,“曹操是汉代丞相曹参后人”这一说
法有误;而现有的夏侯氏基因与曹操家族基因也不一致,因此曹操从夏侯氏抱养的说法
也不准确。新民网记者今天(11日)获悉,复旦大学课题组宣布完全确定曹操家族DNA,
围绕曹操及其家族的身世、遗传之迷也随之逐步破解。
曹操身世之迷:既非曹参后代亦非夏侯氏抱养
2009年,河南安阳对外宣布发现曹操墓,此消息一出即引发轰动,亦引发争议。随后,
复旦大学人类遗传学实验室宣布,拟用DNA技术开展对曹操家族DNA的研究。
曹操本是生活在2000年前的历史人物,寻找他的DNA似乎遥不可及。课题随即开始另辟
蹊径:能不能用现在人的基因反推曹操的基因,从而破解曹操的身世之迷呢?
要把曹操后人与2000年前的曹操进行“亲子鉴定”,首先需要的是可靠的样本。课题组
李辉教授告诉记者,从2009年起,专家组在全国各地采集了79个曹姓家族的280名男... 阅读全帖
a******s
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27
来自主题: Biology版 - Histone DNA binding
Thanks. I am trying to clarify my question.For most of transcription factors
, there is a specific binding site (consensus sequences) on DNA for them to
bind. Without them, no binding. We can use ChIP or EMSA to test it. However,
for histone, there is no specific binding site on DNA. But histone binds to
any DNA. So we call that the histone-DNA binding is specific, but non-
sequence specific.But for some proteins, they may have some kind of
association, but not direct binding with DNA. So my que... 阅读全帖
w**6
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28
来自主题: Biology版 - 科普下DNA史
看到有人把今年化学诺奖和DNA扯到一起,但基本是以讹传讹,看不下去了,所以来科
普一下DNA史,和这个诺奖倒是颇有几分相似。。。
DNA发现是个充满争议的事件,尤其是近几十年来女权分子四处散发谣言颠倒黑白搞得
真相越来越遥远。有兴趣的可以把相关的wiki和文献好好读读。如今蒙冤的不是
Franklin,而是Wilkins。用现在的眼光看,Wilkins是系/实验室的二把手,事实上的
PI(老大Randall基本不做研究了),Franklin只是做了一个薄厚的工作--拍了个X衍
射光片(非晶衍射,和养晶体没有毛关系),这个片片上的X图样给Watson/Crick的双螺
旋理论提供了直接证据(出于对纤维衍射缺乏理解,Franklin自己并不相信双螺旋)。
但是双螺旋理论并不是世人普遍认为的是Watson/Crick的成果,首先琢磨出这个理论的
是Stokes和Wilkins。Wilkins是典型的老好人,把美国人当朋友毫无防备,从理论到实
验结果一点不遮掩,而且Watson/Crick的老板Perutz作为MRC委员也知道Wilkins/
Franklin的工作进展,Watson/Cric... 阅读全帖
a****o
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29
来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 《Nature》: “垃圾”DNA的新启示 zz
《Nature》: “垃圾”DNA的新启示
新手指南大全导航帖【看完本贴,就能玩转星荧】
虽然名为“Junk DNA”但实际上,很多科学家已经为这些重复序列DNA正名了,垃圾DNA
不仅不再是无用的基因组序列,反而成为具有多种功能的重要序列,比如说,垃圾DNA
曾被发现对人类的进化具有重要的作用,Nature的一篇文章又发现垃圾DNA的新功能,
文章Targeted deletion of the 9p21 non-coding coronary artery disease risk
interval in mice解析了垃圾DNA与心脏疾病的可能关联。
参与研究的有来自美国国立Lawrence Berkeley实验室基因组研究部,美国能源与基因
组研究所,美国西南医学中心遗传分子实验室,内科研究实验室的科研工作者。通讯作
者是来自Lawrence Berkeley实验室和能源与基因组研究所的Len A. Pennacchio教授。
在基因组中存在有一部分不能表达蛋白的非编码序列,有很长的一段时间科学家们没有
认为这些非编码的作用,因此,这些重复的DNA片段被冠以垃圾DNA(Junk
t******e
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30
目前猜测各种Y-DNA的来源,和史前人群的迁移路线,主要是靠分子人类学/考古/语言
方面的证据,但古代文化可以相互影响,语言也可以被置换, 相对而言,还是分子人
类学要靠谱一些。
分子人类学的方法一是从现在的分布看那里分类最复杂,那里就有可能是扩展前的来源
地,对于C, 下属种类最复杂的就是东南亚。还有一方法是测古代的DNA, 如在认为是匈
奴墓的人骨测得Y-DNA,大都以Q为主,在西边夹杂R,在东部夹杂C和N,所以现在认为匈
奴和叶尼塞语的关联相当大,没有测到O,而华夏是以O3为主流的,所以司马迁的胡扯“
匈奴其先祖夏后氏之苗裔也”应该是基本破产。
但分子人类学也不是没有问题,最大的问题是,大的Y-DNA haplogroups的形成时间都
远远超过了现代民族的形成时间,那汉为例,最多是5千年,也有可能只有3.5千年,而
其主流Y-DNA的O3有2.5-3万年,其它大的Y-DNA的形成时间也类似,所以使用大的Y-DNA
haplogroups来判断“北方少数民族融入汉族“"意义不大,因为搞不清楚是汉民族形成
之初就有的,如一些Q,就被认为可能是原汉藏人群就有了(远在汉民族形成之前),... 阅读全帖

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31
海昏侯DNA可以用来分辨刘邦和汉武帝的皇室血统
导读:我们发现了墓主人的牙齿,这是一个非常重要的发现。因为有了牙齿,就可以知道
墓主人的年龄,平时喜欢吃什么样的食物,有什么样的病,还可以做DNA的测序。现在
我们国家刘姓DNA资料还是蛮齐全的,但是这些DNA 资料里,搞不清楚哪一个是刘邦和
汉武帝传下来的皇室血统。有了海昏侯的牙齿就可以实现了,他是正宗的皇室成员,汉
武帝的嫡亲孙子...

**还没下到一半,扑鼻而来一阵阵香味**
2011年3月23日一大早,江西电视台新闻热线接到电话,说村民在南昌郊区墎墩山
发现古墓被盗。电视台立即跟我们考古部门联系。
当天下午,我刚刚出差回来,正在家里给老婆孩子做饭。考古所原所长樊长生的电
话就来了,他说我们现在都在外面,你去看一下。我说我也刚刚回来,是不是明天去。
所长跟我强调,他说这个地方在新建县的铁河。
他说了这句话之后,我马上反应过来——铁河这个地方有很多汉墓,这一带很可能
是文献记载的海昏侯昌邑王曾经待过的地方。听他这么一说,我马上朝口袋里一看,还
有200块钱,差不多够打车了,于是放下东西就出了门。
我们一路赶过去,到达被... 阅读全帖
f***y
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32
http://360zhyx.com/home-research-index-rid-66033.shtml
2016年9月15日,南京大学的周国华研究员、赵庆顺教授和朱敏生教授在《Genome
Biology》杂志上发表了一项重要的研究,一种新DNA编辑工具:结构引导内切酶SGN(
structure-guided endonuclease)。SGN工具与现有的DNA编辑工具不同,最强大之处
就是不受靶序列的限制,能特异性识别和捕获目标,来准确切割任何DNA序列。
而目前,其他DNA编辑技术,如最热门的CRISPR-Cas技术,争议最大的韩春雨发现的
NgAgo技术,还有ZFN、TALEN等技术,都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序
列偏好的限制。
2016年5月,河北科技大学的韩春雨教授在《Nature Biotechnology》杂志上发布了一
种可以替代CRISPR-Cas的基因组编辑技术:NgAgo技术。因为这样一篇突破性的研究论
文,韩春雨教授从一个学术圈的“泛泛之辈”一跃成为“诺贝尔奖级别的科学家”。然
而,由于实验重复性的问题,很多国内外学者发现实验无法重复,韩春... 阅读全帖
l***8
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33
生物学重要发现:
人和感冒病毒的DNA 50%相同
人和蘑菇的DNA 75%相同
人和仙人掌的DNA 90%相同
人和跳蚤的DNA 95%相同
人和鲤鱼的DNA 98%相同
人和老鼠的DNA 99%相同
人和大猩猩的DNA 99.9%相同
人和黑猩猩的DNA 99.99%相同
S*******l
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34
可以啊,ancient DNA现在是很火热的领域。现在发现一个部位DNA保存比较好,头颅骨
内耳耳蜗部位的小骨头 petrous bone。最致密,保存死者DNA最好,也不容易被外源
DNA污染。配合二代测序,可以获得丰富的古DNA数据。
所以近年ancient DNA文章爆炸式增长。
The Skull’s Petrous Bone and the Rise of Ancient Human DNA: Q & A with
Genetic Archaeologist David Reich
https://biobeat.nigms.nih.gov/2018/04/the-skulls-petrous-bone-and-the-rise-
of-ancient-human-dna-q-a-with-genetic-archaeologist-david-reich/
s****4
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35
来自主题: Talk版 - 抽血管上有三个字母——DNA
看到了斑竹的置顶声明,但似乎这里最近还有不少有关法轮功的文章,所以冒昧一贴,
在此仅请斑竹谅解,这帖意在劝善救人,谢谢
更多真相, 请到真相之光俱乐部
http://www.mitbbs.com/club_bbsdoc2/everybodydeservestruth_0.htm
抽血管上有三个字母——DNA
文/印证
【明慧网二零一四年三月二十日】记得我被非法关押在某女子监狱期间,被抽过血,我
看到在发给我的一个抽血试管上面写有三个字母——DNA,至今记忆深刻。当时,我只
知道,DNA和遗传基因有关系,是用于亲子鉴定的,为什么要给我们测DNA?觉得非常奇
怪,这个疑问一直存在我心中。
直到近期我和一位做医生的法轮功学员一起查了相关资料,当我看到资料上写着:器官
移植前首先要检测DNA,联想到明慧网上对活摘法轮功学员器官的报导,我什么都明白
了:原来中共对所有被非法劳教、非法判刑的法轮功学员抽血检验、检测DNA都与活摘
器官有关!抽血检验信息、DNA检测结果都进入档案备案,以待需要活摘器官时,随时
提供信息。
正如明慧网二零一三年十二月八日刊登的文章“为什么要强制检验他们的DNA?”结尾... 阅读全帖

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36
现在认为发现DNA结构的过程中,Watson是个盗贼和掮客:
Elwyn Beighton在1951年最早知道DNA的x-射线衍射图有一种叉叉图形
Pauling发现蛋白质aloha螺旋的X射线衍射图具有叉叉图形,但是老先生没有做过DNA样品
B-DNA样品(纤维)最早是Wilkins做出来的,但是结构不完美,只能看到X形状的模糊
衍射图
精确DNA纤维解析是Franklin完成的,她的著名的Photo 51的解析度清晰到可以看出一
个螺旋有10个碱基对。
photo 51
结构是Crick解出来的,正确结构解出来之前的第一个结构被Franklin指出了是完全错
误的。这个时候Franklin犯了第二个错误,没有加入竞争解析DNA结构。
Watson第一次知道凡是alpha helix的生命物质在X射线衍射图上是一种X形状的图,那
是Pauling做报告时他知道了的。他把这个观点灌输给了Crick。
在整个发现DNA结构过程中,Watson去翻看Franklin的笔记本,看到各种各样的X形状图
片,然后Wilkins给他看Franlin的一张最新的更清晰的图(Photo 51),老头没... 阅读全帖
s***e
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37

DNA弹性是很关键的.150 bp以下的DNA很难弯曲. 所以要形成一个核小体, core
histone protein需要作许多功来弯曲DNA. 不过现在这几个新实验表明, 弯曲150bp以
下的DNA比从前认为的要容易许多.
缺陷的意思是, DNA局部因为某种结构变化, 比B-DNA更软. Melting是指几个被破坏的
bae pairs. 破坏h-bond需要能量. 所以这是一种激发缺陷.
量>
.
现实DNA的弹性在200 bp以下不能用传统的弹性模型描述. 具体表现上是变得"更软".
DNA更容易被弯曲, 所以looping需要的能量更小.
s***e
发帖数: 911
38
现在这个问题不平庸了.
以前认为DNA具有线性弯曲弹性. 小于50nm的DNA成环需要的能量太大, 没有外部帮助的
情况下,基本不可能自发成环. 对小DNA链来说, 成环最小需要的弯曲能是:
Eb/KT=2*pi^2*50nm/L. 所以L=150 bp的DNA成换需要至少克服20 KT的energy barrier. 如果
100 bp成环需要克服大概30 KT的energy barrier.
最近西北大学的Widom的lab用T4 ligase作了成环实验. 成环概率大过理论结果up to
10,0000倍.
我们提了一个理论解释, 能很好的解释他们的结果. 就是热激发的连续几个base pair的
melting导致一些local defects. 这些local defects很稀少, 所以对长的DNA不起作用.
对短DNA的极限情况会有很大影响. 严格的理论计算结果果然如此.
Melting机制会使成环概率敏感依赖于温度.另外Melting机制也会影响到DNA的
twist rigidity. 这两个预言最近被Widom的新实验支持了.
所以我现在的看法是: 多小的DNA都能
g*********d
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39
据英国《每日邮报》1月7日报道,英国科学家找到了“急性癌症”的形成原因:细胞内
的染色体发
生“爆炸”破坏了DNA,从而让人有可能在短时间内患上癌症。相关论文发表于《细胞
》。
传统理论认为癌症是人体经历成千上万次的细胞突变后,慢慢演化的结果。但英国著名
的疾病研究机
构桑格研究所的新发现推翻了这种看法。这暗示了不管人们怎么努力保持身体健康,也
不能保证命运
不会拿他们开玩笑。同时还说明了为什么有些人在体检时根本没发现癌症痕迹,但数月
后突然就被诊
断患上这种疾病了。
桑格学院的科学家是通过研究750个肿瘤的遗传缺陷后得出以上结论的。其中大部分的
案例都与传统
理论相符,染色体的损坏是常年累积的结果。然而,其中至少有1/40的肿瘤不符合“标
准模式”,有的
染色体似乎是在一夜之间遭到破坏的。
参与此项研究的坎贝尔博士称:“测验结果太让我们惊讶了。在一个细胞里面,染色体
经过一次或者是
多次爆炸成为碎片。如果这个细胞开始笨拙地修补,把碎片杂乱的缝合起来,这样就破
坏了原来的
DNA结构,为癌症的快速形成提供了条件。”
坎贝尔博士表示:“这个细胞应该说‘好吧,我放弃’,而不是像对待昂贵的瓷... 阅读全帖
w**6
发帖数: 12
40
来自主题: Biology版 - 科普下DNA史
你这发言还算还有点知识,谢。完全不象有些人信口喷粪。懒得和那些垃圾争论。
这个DNA双螺旋发现和分辨率没有关系,这个是非晶衍射,衍射图上的X本身就基本(非
完全)说明了DNA是双螺旋。纤维衍射是fourier-bessel, 而B-DNA天然就是很完美的双
螺旋,所以会有很完美的X图,不需要养晶体。所以Franklin拿到Wilkins的B-DNA样品
后,得到Photo51基本只是日常实验操作。当然Franklin是个很不错的晶体学家,可惜
她太执著与解析结构本身,完全没有认识到X的重要性,这就是为什么她甚至搞了个双
螺旋已死的仪式(为什么有这个仪式?因为Wilkins等根据早期结果已经在猜测证明双
螺旋了)。
Watson/Crick的模型基本是根据概念拼凑的,所以细节基本是错的,DNA结构真正证明
/解析到大约5A的工作是Wilkins急队伍做的。而纤维/螺旋衍射的理论,也是Wilkins
要Stokes琢磨出来的(早于Watson/Crick),这个wiki上和出版上都非常明确的。
Photo51也完全不是如行外传说的那么重要,因为Wilkins之前已经有明确带有X图样的
衍射... 阅读全帖
r**********e
发帖数: 587
41
来自主题: Biology版 - DNA damage/repair实验请教
谢谢。
你说的非常对,PCR来检测DNA repair非常罕见
我要解释一下,
我压根不是做DNA damage/repair的,我有兴趣的一段疾病相关的序列repetitive
simple sequence,根据各种原因我相当怀疑是和DNA damage/repair相关的。我的
hypothesis是:这段疾病相关的repetitive序列或许更加vulnerable to 外界的DNA
damage, 或者DNA repair的修复能力跟其他普通序列不同,从而能为疾病机制提供新
的发现
我看了大部分DNA damage/repair领域的文章,我感觉大部分的工作都是global的比如
测量一下DNA损伤的marker比如H2AZ或者H3k56ac的level。但我的兴趣一定是需要精确
到DNA-specific或者gene-specific的
能精确到sequence-specific的我能想到的也就是PCR了
相关的研究也有,比如:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24371283
我顺便也好奇问下,repair领域大家是不care ge... 阅读全帖
B*******c
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42
2016年9月15日,南京大学的周国华研究员、赵庆顺教授和朱敏生教授在《Genome
Biology》杂志上发表了一项重要的研究,一种新DNA编辑工具:结构引导内切酶SGN(
structure-guided endonuclease)。SGN工具与现有的DNA编辑工具不同,最强大之处
就是不受靶序列的限制,能特异性识别和捕获目标,来准确切割任何DNA序列。
而目前,其他DNA编辑技术,如最热门的CRISPR-Cas技术,争议最大的韩春雨发现的
NgAgo技术,还有ZFN、TALEN等技术,都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序
列偏好的限制。
2016年5月,河北科技大学的韩春雨教授在《Nature Biotechnology》杂志上发布了一
种可以替代CRISPR-Cas的基因组编辑技术:NgAgo技术。因为这样一篇突破性的研究论
文,韩春雨教授从一个学术圈的“泛泛之辈”一跃成为“诺贝尔奖级别的科学家”。然
而,由于实验重复性的问题,很多国内外学者发现实验无法重复,韩春雨的NgAgo技术
,被学术界和媒体引入了强烈的争议风波。
可是,目前SGN工具的出现,让争议不断的NgAgo... 阅读全帖
b********g
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43
来自主题: Biology版 - DNA体积不到细胞核的1%
话说人的DNA 有 3 billion (3E9)个碱基,按照DNA 双螺旋模型,每10个碱基形成一个
圆柱体(直径为2nm, 每个碱基间的间距是0.34 nm); 那么这么多DNA 的体积为:
pi * (1 nm)^2 * 0.34 nm * 3E9 = 1.02 pi 10E9;
DNA 在细胞核中,假设细胞核的半径为10 um = 10E4 nm, 为球形,其体积为,
1.3 * pi * (10E4)^3 = 1.3 pi 10E12;
不难看出,DNA 只占细胞核体积的千分之一。
如果,细胞核缩小为 5 um, DNA 充其量也不到细胞核体积的百分之一。
因此,细胞拥有足够的容量来容纳DNA,那么,细胞为何要用其他蛋白(histone,
cohesin, chromatin remodeling complex, HP1)来压缩DNA,从而形成所谓的higher
order chromatin structure?
表达调控。
a****o
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44
【 以下文字转载自 Harvard_Medical_School 俱乐部 】
发信人: amedio (Boasting Father), 信区: Harvard_Medical_School
标 题: 《Nature》: “垃圾”DNA的新启示 zz
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 25 11:37:31 2010, 美东)
《Nature》: “垃圾”DNA的新启示
新手指南大全导航帖【看完本贴,就能玩转星荧】
虽然名为“Junk DNA”但实际上,很多科学家已经为这些重复序列DNA正名了,垃圾DNA
不仅不再是无用的基因组序列,反而成为具有多种功能的重要序列,比如说,垃圾DNA
曾被发现对人类的进化具有重要的作用,Nature的一篇文章又发现垃圾DNA的新功能,
文章Targeted deletion of the 9p21 non-coding coronary artery disease risk
interval in mice解析了垃圾DNA与心脏疾病的可能关联。
参与研究的有来自美国国立Lawrence Berkeley实验室基因组研究部,美国能源与
a****o
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来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 高通量DNA测序技术在生物学研究的应用 (转载)
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 高通量DNA测序技术在生物学研究的应用
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 23 22:31:49 2009, 美东)
导读:有很多生物学工作者尽管知道高通量技术的大概原理,但是却以为它仅仅是更快
而已。其实高通量DNA测序技术不仅仅是替换传统的测序技术,它有三大优点是毛细管
测序法所不具备的。首先它把平行处理的思想用到极致,可以在几百万个点上同时阅读
测序,所以它是快速高通量的技术,这一点是大家所熟知的;另外它实质上是单分子
DNA的测序技术,通过单分子DNA结合在某个点上进行扩增测序,所以它可以测一个DNA
的mixture(混合);最后由于在一个 mixture中某种DNA的丰度反应在它能在多少点上
结合并被测序,也就是说被测序的次数反应了DNA的丰度,这个技术还有非常完美的定
量功能。
高通量DNA测序技术已经在如下领域掀起了革命。
测基因组的:
1. re-annotation of the genome。测序难免有错误,通过反复的深度测序,可以
e****o
发帖数: 268
46
来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 高通量DNA测序技术在生物学研究的应用 (转载)
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
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标 题: 高通量DNA测序技术在生物学研究的应用
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 23 22:31:49 2009, 美东)
导读:有很多生物学工作者尽管知道高通量技术的大概原理,但是却以为它仅仅是更快
而已。其实高通量DNA测序技术不仅仅是替换传统的测序技术,它有三大优点是毛细管
测序法所不具备的。首先它把平行处理的思想用到极致,可以在几百万个点上同时阅读
测序,所以它是快速高通量的技术,这一点是大家所熟知的;另外它实质上是单分子
DNA的测序技术,通过单分子DNA结合在某个点上进行扩增测序,所以它可以测一个DNA
的mixture(混合);最后由于在一个 mixture中某种DNA的丰度反应在它能在多少点上
结合并被测序,也就是说被测序的次数反应了DNA的丰度,这个技术还有非常完美的定
量功能。
高通量DNA测序技术已经在如下领域掀起了革命。
测基因组的:
1. re-annotation of the genome。测序难免有错误,通过反复的深度测序,可以
m****g
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来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 研究显示癌症与某些“垃圾DNA”有关
英国研究人员日前报告说,人类基因组中一些“垃圾DNA”产生的物质与乳腺癌等癌症
存在相关性,这项发现有助于研发新
的癌症治疗方法。
英国诺丁汉大学等机构研究人员在美国《基因组学》(Genomics)杂志上报告说,他们
发现人类基因组中名为L1的DNA
序列会导致生成一些反常产物,而这些产物多见于乳腺癌细胞中。
DNA即脱氧核糖核酸,它可以组成遗传指令,指导细胞合成蛋白质等物质。据介绍,序
列L1常被称为“垃圾DNA”,因为它
是人体内的非编码DNA,不像编码序列那样指导合成特定蛋白质。但研究人员在乳腺癌
和肠癌细胞中发现了序列L1导致生
成的反常产物,因此上述癌症可能与L1等“垃圾DNA”功能异常有关。
研究人员指出,序列L1携带一个“开关”,可以随机开启附近基因,如果这些基因被不
适当地启动,就会生成反常产物,对
细胞正常功能造成影响。通常,正常细胞中都有抑制这个“开关”的化学物质,但在一
些癌细胞中,这些抑制物质却消失了。
研究人员正试图确定,是一些“垃圾DNA”的上述特殊“开关”启动导致了癌症,还是
癌症导致该“开关”启动。但无论如何,这
些“垃圾DNA”至少可以成为癌症治疗中有
o***s
发帖数: 42149
48
几天前,一块嚼过的口香糖被送到了湖南省芙蓉司法鉴定中心。带着样本前来的,是一位姓林的女士。她怀疑丈夫出轨并且有了私生子,便聘请了某“调查公司”介入,想办法弄来了“私生子”嚼过的口香糖,因为那上面粘的口腔黏膜细胞能用来做亲子鉴定。
起因 林女士欲通过亲子鉴定扫除疑问
林女士是郴州人,今年40岁,和丈夫已经结婚十来年,孩子都读中学了。这几年,她一直听到风言风语,说她丈夫在外头养了小三,还生了个男孩。这件事把林女士快折磨疯了,她考虑许久,决定雇佣一家“调查公司”,让私人侦探替她搞清楚是怎么回事。
“调查公司”给林女士的答复,让她更加深陷痛苦:真的有那么一个女人及其4岁的男孩很可疑。她决定设法做一次亲子鉴定,至少能搞清楚真相。于是,私家侦探想办法接近了男孩,给他递了块口香糖,再悄悄跟在孩子后头,捡起了他嚼完吐出的口香糖残渣。
鉴定 丈夫太细心,只好从亲生孩子取样
孩子的样本有了,但林女士的丈夫似乎察觉了什么,几乎没留下什么可以用来做鉴定的痕迹。他不嚼槟榔、不抽烟,再加上夫妻间不和,他也不怎么在家住,林女士连根头发都捡不到。最后,她只好取了自己亲生小孩的头发。如果证明两个样本有兄弟关系,那么她... 阅读全帖
c***s
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49
今天下午,湖南祁阳14岁“少女妈妈”思思(化名)将带着刚出生13天的宝宝,坐上前往北京的火车。思思父母希望她到北京后,前往派出所为孩子做DNA鉴定,以确定这个女孩儿的生父到底是谁。
这已是思思三度怀孕、二次产子。两年前,12岁的思思曾被性侵产下一女。两个孩子的命运是如此相似,一出生就面临生父是谁的纷争和疑云。而一旦确认,等待孩子生父的,将是不可逃避的刑罚。
回不去的家
9月9日晚,躺在祁阳县一家医院的病床上,思思情绪看起来还不错。
邻床产妇因为刚生孩子没有奶,拜托思思喂几口孩子。思思很配合,接过对方的小孩抱在怀里喂奶。
“你知道吗,昨天我喂她的时候,我的小孩还哭呢,不让我喂。”思思略带惊奇,笑着告诉记者,“这么小就知道吃醋了!”
8月29日,思思剖腹产下自己的第二个孩子。
孩子出生前,她已经为孩子想好了名字,如果是男孩叫什么,女孩又叫什么。
今天下午,思思将带着刚出生13天的孩子乘坐9个多小时的火车,前往北京。“我的伤口还好疼。”
为什么不等到满月再走?思思说,爸爸不让她回家,“嫌我丢人”。
母亲王小英从8月29日开始一直在医院照顾思思,她说自己无法说服思思父亲让她留下,“她爸的脾气,... 阅读全帖
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