由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: vitro
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l***d
发帖数: 1828
1
很有意思的科普文章
http://www.ccthere.com/article/3107327
[诺贝尔2010]爱德华兹:试管婴儿荆棘路 [ 游识猷 ]
新鲜出炉的诺贝尔物理学奖两名获奖者加起来一共87岁,而新科诺贝尔生理学奖得主罗
伯特·爱德华兹(Robert Edwards)一人就85岁,由于健康状况欠佳,诺贝尔委员会甚
至无法直接向他道贺,他的夫人露丝·福勒(Ruth Fowler)在得知获奖消息后代他表
达了喜悦之情。
爱德华兹——试管婴儿之父、剑桥大学退休教授、英国皇家学会会员、2001年拉斯克临
床医学奖得主、2010年诺贝尔生理学奖得主。他将独享一千万瑞典克朗(将近一百五十
万美元)的奖金——主要是因为另一名重要的合作者,产科医生帕特里克·斯特普托(
Patrick Steptoe)早在1988年便撒手人寰,假如斯特普托能活到今天分享诺贝尔奖,
该有97岁了——你看,要活到拿诺贝尔生理学奖的确是一件不容易的事情。
这个诺贝尔奖,爱德华兹可说受之无愧——首先,活到今天不容易;另一方面,整个研
究过程也是相当之曲折。
爱德华兹,1925年9月27日生于英国曼彻斯特。上个世... 阅读全帖
n********k
发帖数: 2818
2
Joke of the day or what?
there is not a most shameless but more shameless!
Results: 33
1.
Viable fertile mice generated from fully pluripotent iPS cells derived from
adult somatic cells.
Zhao XY, Li W, Lv Z, Liu L, Tong M, Hai T, Hao J, Wang X, Wang L, Zeng F,
Zhou Q.
Stem Cell Rev. 2010 Sep;6(3):390-7.PMID: 20549390 [PubMed - in process]
Related citations
2.
Production of mice using iPS cells and tetraploid complementation.
Zhao XY, Lv Z, Li W, Zeng F, Zhou Q.
Nat Protoc. 2010;5(5):963-71. Epu... 阅读全帖
n********e
发帖数: 19
3
来自主题: Biology版 - 请教一个拉丁用法
谢谢指教。
那种在试管里面做purified protein modification,interaction, degradation,等
等,这些也是in vitro。那在细胞里面表达至少也是个活物吧。我只是在想在in vitro
和in vivo之间还有些什么说法
w*e
发帖数: 740
4
来自主题: Biology版 - 请教一个拉丁用法
不同的领域对 IN VIVO和IN VITRO的理解不一样的
有的特别严格:一切实验都是在动物活体内进行,直到SAMPLE被固定后取出
有的领域特别松:只要不是CELL FREE的体系,就是IN VIVO

vitro
p******x
发帖数: 1264
5
来自主题: Biology版 - 请教一个拉丁用法

vitro
是活物,但是细胞系和体内实际环境没可比性。养细胞在我们这块肯定是算作in vitro
了。上面也说了不同领域概念有差别。
t******y
发帖数: 716
6
来自主题: Biology版 - Protein Ubiquitination protocol
IP目的蛋白后,用anti-Ub的抗体,western检测。或者直接纯化目的蛋白,用in vitro
Ubiquitination assay检测,biomol有卖in vitro的试剂盒。
g*********d
发帖数: 233
7
人们都知道锻炼身体可以促进新陈代谢,有益于心血管健康,但此前科学家对运动究竟如何影响心脏
却所知甚少。美国哈佛大学医学院的研究人员日前报告说,他们首次从分子水平发现运动有益心脏健
康的机理,这一发现将有助于开发出治疗心血管疾病的新疗法。
研究人员通过小鼠实验发现,经常运动可以使小鼠体内的C/EBPβ转录因子水平显著下降,其结果会促
进小鼠心脏肌肉细胞增殖,有益于心脏生长。此外,研究人员还发现,体内C/EBPβ水平较低的小鼠对
心力衰竭具有抵抗能力。
研究人员表示,这项研究对心脏肌肉再生的潜力有了深入理解。参与研究的哈佛大学医学院教授安东
尼·罗森茨魏希表示,通过这项研究可以开发出针对那些无法运动的心脏病患者的疗法。
这项研究成果发表在新一期美国《细胞》杂志上。
C/EBPβ Controls Exercise-Induced Cardiac Growth and Protects against
Pathological Cardiac Remodeling
Cell, Volume 143, Issue 7, 1072-1083, 23 December 2010
10.1016/j... 阅读全帖
i***R
发帖数: 663
8
来自主题: Biology版 - "we produced CFTRΔF508/ΔF508 pigs"
这不知道得多大的场地做实验。
Sci Transl Med 16 March 2011:
Vol. 3, Issue 74, p. 74ra24
DOI: 10.1126/scitranslmed.3001868
RESEARCH ARTICLE
CYSTIC FIBROSIS
The ΔF508 Mutation Causes CFTR Misprocessing and Cystic Fibrosis–Like
Disease in Pigs
Lynda S. Ostedgaard1,*, David K. Meyerholz2,*, Jeng-Haur Chen1,3,*,
Alejandro A. Pezzulo1, Philip H. Karp1,3, Tatiana Rokhlina1, Sarah E.
Ernst1, Robert A. Hanfland4, Leah R. Reznikov1, Paula S. Ludwig1, Mark
P. Rogan1, Greg J. Davis1, Cassie L. Dohrn2, Christine Wohlford-L... 阅读全帖
t****p
发帖数: 1504
9
【说明
首先抱歉,标题是为了吸引眼球。而且,读者可以看到,本文介绍的工作并不适合用院
士与否来评价,所以题目应该被批判。本文作为非正规博文一周后,题目将改回以下正
文的标题。正文目前作为征求意见稿,也将适当修改后发表于正式刊物,这相反于我平
时一般先正式发表后请科学网置于博客的习惯。
在科学界,我有双重身份:正在实践的科学家和对历史与现实的评论员。第二身份包括
我对科学史的兴趣。以前以介绍其他人研究过的科学史为主,近年对感兴趣较长的中国
近代科学史,我通过和北大医学部张大庆老师和研究生黎润红的合作,获得了一些史料
、正在写文章。如何呈现本文要讲的工作,也得益于“GSK终身生命科学成就奖”评奖
委员会的同事们的讨论,他们是鲁白、傅新元、马红、王小凡。
因为最近我第一身份出现一些情况,引起了出乎我意料的关注,为了避免继续过度解读
,而将其中无意义的部分转化为较有意义的事情,我为本文加上目前对我博客感兴趣的
外界人士可能注意的标题。
本文主旨是希望中国重视一些在国内做出了杰出工作、而未获适当承认的科学家。本文
要介绍的两位人物年龄都较大,其中一位还在病中。他们做出的贡献,在我(作为科学
的评... 阅读全帖
w***a
发帖数: 4361
10
来自主题: Biology版 - adipogenesis还有的做么?
in vitro adipogenesis有个最大的limitation就是无法区分
depot-specific differences,实际上身体各处的fat,
比如omental和subcutaneous fat 的behavior区别狠大。对于这个的研究,
不管是in vitro的3T3 cell 还是precursor stem cell都搞不定。
t*******o
发帖数: 71
11
【写在前面的话】
首先抱歉,标题是为了吸引眼球。而且,读者可以看到,本文介绍的工作并不适合用院
士与否来评价,所以题目应该被批判。本文作为非正规博文一周后,题目将改回以下正
文的标题。正文目前作为征求意见稿,也将适当修改后发表于正式刊物,这相反于我平
时一般先正式发表后请科学网置于博客的习惯。

在科学界,我有双重身份:正在实践的科学家和对历史与现实的评论员。第二身份包括
我对科学史的兴趣。以前以介绍其他人研究过的科学史为主,近年对感兴趣较长的中国
近代科学史,我通过和北大医学部张大庆老师和研究生黎润红的合作,获得了一些史料
、正在写文章。如何呈现本文要讲的工作,也得益于“GSK终身生命科学成就奖”评奖
委员会的同事们的讨论,他们是鲁白、傅新元、马红、王小凡。

因为最近我第一身份出现一些情况,引起了出乎我意料的关注,为了避免继续过度解读
,而将其中无意义的部分转化为较有意义的事情,我为本文加上目前对我博客感兴趣的
外界人士可能注意的标题。

本文主旨是希望中国重视一些在国内做出了杰出工作、而未获适当承认的科学家。本文
要介绍的两位人物年龄都较大,其中一位还在病中。他们... 阅读全帖
j****x
发帖数: 1704
12
in vitro和in vivo上的差异还是很大的,要在in vivo上做出点新意来,相对而言不是
很难的事情,也更容易发好paper,如果结果靠谱的话。
当然也要看这个通路的表型,如果是重要疾病相关的话,in vivo的意义肯定要大得多
。我们这里类似的一个项目,in vitro 2年前发了gastroenterology,in vivo的后续
今年刚投了nature medicine,minor revision。
j*****d
发帖数: 787
13
http://www.nature.com/cr/journal/vaop/ncurrent/full/cr2011158a.
anybody has full access? thanks.
However, they did not provide evidence that miRNA168a directly
travels from rice grains to human/animal stomac to serum (whose serum????)
and, timely, survive to what extent. Their functional study (miRNA168a
targets LDRAP1) acctually is an in vitro manipulation.
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
cross-kingdom regulation by microRNA
Lin Zhang, Dongxia Hou, Xi... 阅读全帖
c**********5
发帖数: 653
14
来自主题: Biology版 - Google好像不work,到这里来问吧
in vitro( refered to "in glass") as compared to experiments using intact
organisms in vivo (" in living organisms"). But in biochemistry lab, in
vitro means in reacitons in test tube whereas "in vivo" refers to any
reaction occurs inside a living cell
l**********1
发帖数: 5204
15
搞湿的In Vivo In vitro 水系的筛选的 目前尚不理解搞干的结晶 in vivo vitro X-
ray 数据解析筛选 也可能是一个新行当
361/N行吧? SHI YI Gong 行头within mainland China.
v***a
发帖数: 1242
16
来自主题: Biology版 - 文章这样写,逻辑行得通吗?
老板不赞同我的想法,要把我做了2年的1/2数据给一笔勾销(因为认为无法解释),把
剩下的变成一篇很简单的paper,可我觉得自己的逻辑也没有问题啊,请大家帮忙看看
哈!
已知组织中有2种细胞相互作用(但整个组织中不止这2种细胞)。in vivo的老鼠实验
证明,某药物的treatment会引起该组织中蛋白O和P的表达量急剧上升(蛋白O和P有co-
immunoprecipitation)。正常情况下,整个组织的蛋白O和P表达量很低,2种相互作用
的细胞也是一个2种蛋白的表达量都非常高(代号为1),一个表达量都很低(其表达比
例跟整个组织水平持平或略高;代号为2)。
在in vitro情况下单独培养细胞1,用上述的药物进行处理,没有发现蛋白O的表达量有
变化,但是蛋白P在后期有上升。如果在细胞1中超量表达蛋白O,蛋白P表达量会在后期
显著增加。
把细胞1和2在in vitro的条件下共同培养,再用药物处理,发现O也有上升。
另外发现,细胞2和细胞1共同培养能诱导蛋白O的表达量增加。
我得出结论说,药物通过刺激细胞2,进而使细胞1中的蛋白O增加,再诱导蛋白P增加,
激活其它信号通路。但我也... 阅读全帖
D*a
发帖数: 6830
17
来自主题: Biology版 - 我前老板的试错法
in vitro和in vivo差别大了去了。我们实验室都木有in vitro
m**********d
发帖数: 137
18
来自主题: Biology版 - 有谁做tumor imaging么
in vitro用luciferase标记肿瘤细胞,打入体内,用bioluminescence和PET/CT跟踪肿
瘤生长和转移
有个很基本的问题没搞明白,我查看实验室前人的notebook发现他当年用transient
transfection转染了一个表达luciferase的plasmid进去,用puromycin筛选一段时间,
就打进老鼠里去了,我在想他为啥不用lentivirus来做stable cell,像他那样做的
transient transfection随着肿瘤细胞的不断分裂岂不是早被dilute了,就算在in
vitro一直有puromycin的selection pressure,那达到体内之后呢?总之觉得不大靠谱
,可那位前辈已经离开了lab,所以来这里请教请教
多谢
s******r
发帖数: 2876
19
in vitro转染你肯定影响分化?
等你的老鼠杂出来,搞不好一年都过去了。
为什么不先试病毒。

实验室用gene(A)ko的老鼠,我现在想分离一些原代细胞和干细胞再打回到
nude mice里去。所以想用GFP或者luciferase来标记这些细胞,但是分离的细胞如
果in vitro转染的话可能影响分化,所以想得到A-/- GFP mice.
but A-/- 不能生育,所以必须用A hetero(-/+)来交配GFP wt,这样可以得到GFP
A-/+. 然后用得到的GFP A-/+ 之间互相交配,可以得到GFP A-/-的老鼠吗?就是gene
A KO 但是同时是GFP+的老鼠?
因为没做过动物,所以不知方法可行吗?
谢谢回复!
l**********1
发帖数: 5204
20
恩 华中比魔都那 牛在天上飞一般地吹也不易露底 啊 Lol
五年剑桥剥尸猴 的被引用次数 能当牛剑或帝国理工的AP/ junior lectureship 不?
Yuhui Sun*, Frank Hahn, Yuliya Demydchuk, James Chettle, Manuela Tosin,
Hiroyuki Osada and Peter F. Leadlay* (2010) In vitro reconstruction of
tetronate RK-682 biosynthesis. Nature Chemical Biology 6:99-101. (*, co-
corresponding author)
注:本论文被英国Faculty of 1000收录(http://f1000.com/)并获专家好评
//pharmacy.whu.edu.cn/NewsDetail.asp?MaxSort=szdw&MaxUrl=teacher&id=201
Title: In vitro reconstruction of tetronate RK-682 bi... 阅读全帖
l********e
发帖数: 415
21
来自主题: Biology版 - 这个实验设计靠谱吗
简单答案 最好都做
如果实在不能都做,
问问自己
1) in vivo还是in vitro? in vitro用什么系统? in vivo用什么系统?
2) 有没有好的antibody?
个人觉得chip-seq不好做. TF的Chip-seq不比histone modification的chip-seq 需要
很好的Ab和很多的cell, 多数只能在cell line/primary cell做.
l*******i
发帖数: 153
22
首先有一个概念要明确:目前说的ES细胞,都是in vitro culture的,与in vivo的不
一样。
ES细胞分为naive和prime两个stage
1)naive stage:ES colony在形态上看起来更“致密”,呈三维结构,对胰酶不敏感(
即胰酶消化不会诱导其凋亡)。对小鼠ES而言,naive的ES来源于inner cell mass(ICM
)。此stage的ES self-renewal更迅速,population double大概只需要12-14小时。对
于其self-renewal的维持需要LIF,stat3,BMP4等。雌性小鼠naive ES的另一个显著特
点是X chromosome reactivation,而在其他类型的细胞中有一条X chromosome是失活的
。从全能性角度来讲,naive ES是真正具有全能性的,能形成完整的个体。
2)prime stage:对小鼠而言,其来源于postimplantation epiblast,是naive stage
的下一个阶段,其形态看起来与naive ES明显不一样,呈“二维”结构,即colony... 阅读全帖
p*****u
发帖数: 276
23
来自主题: Biology版 - 如何对生物loser有利?
看领域了,我做微生物操纵子的,而且是微生物生化,需要in vitro的七八种物化和光
学技术,两年能出一篇5分就算不错,发的时候人家都不愿收,工作量和图量够15分左
右的了,但是课题不时髦,只能降到5,但是篇幅又太大,一般5分的都是小文章。
他们做病原微生物的因为与医学搭边而且不用in vitro的技术所以发文快而且if高。而
且我们这边没有第二作者,只有我一作和老板通讯,所有实验我一个人从头搞定。
所以我自从入了这个领域就全明白了,基本没啥前途,最好的选择就是回国内底层的大
学做讲师,否则就得改行。人基本博士做到什么程度,以后也就能稍微好一点儿,有人
在博后的时候逆袭但那也只能是特例。我自己顺便做个小生意也不缺钱,实在没必要死
磕faculty。

作c
S*********s
发帖数: 304
24
来自主题: Biology版 - 请教一个关于actin和H2O2的问题
还有sunnyday说的这种可能性。
可以直接用买GSSG,sigma就有,in vitro incubate,可以exclue or confirm this
possibility.
另外,你的western band强度不一样啊,in vitro做assay,应当非常一致才对。
S*********s
发帖数: 304
25
这个事情大约应该是这样的。
这也是科研礼节之一,同一个field, 大家既是competitor,同时又是colleague in the
same community.
比别人先做出来,有很多的因素,hard working good luck,nice scientific
environment etc。
在文章正式出来之前,和业界前辈交流一下,表达一下对业界已经做了大量工作的前辈
的尊重。没有别人大量的铺垫性工作,任何突破都是很困难的。尊重别人,才能得到别
人的尊重。
李老师建立了这样的一个easy to use的HBV in vitro model,
使得很多原来不可能做后续工作的实验室可以开展相关的工作。
要知道,原来的可以做in vitro infection的两个cell line需要约一万欧元。
我相信,即使是competitor也会发来“贺电”的。
n********y
发帖数: 187
26
http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-650567.html
研究中药的中医研究院研究员、中国工程院院士李连达发表文章,谈砒霜治疗白血病是
中国人的骄傲(http://blog.sciencenet.cn/blog-715370-650492.html
李连达的文章写道:“砒 霜制剂治疗白血病问题,早在两千年前我国已经对砒
霜的药用价值及毒性有一定认识,在古人经验基础上,近代科学家又进行了深入的研究
,发现砒霜(三氧化二 砷)及青黛、雄黄(二氧化二砷)组成的“青黄散”可以治疗
白血病,其后进一步将砒霜精制成三氧化二砷制剂,又经一系列制剂学、药理毒理学及
大量临床试验, 证实对白血病确实有疗效,陈竺院士及其夫人等专家对其作用机制作
了高水平的研究并有重大发现,得到国内外学术界的公认,使这个药在世界推广使用”
这样的说法,恐怕陈竺和陈赛娟都受不了。
我相信,陈竺和陈赛娟都不会认为自己是发现砒霜治疗白血病的最大功臣,他们肯定同
意我的写法(见http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-478156.h... 阅读全帖
M****o
发帖数: 4860
27
研究中药的中医研究院研究员、中国工程院院士李连达发表文章,谈砒霜治疗
白血病是中国人的骄傲(http://blog.sciencenet.cn/blog-715370-650492.html
李连达的文章写道:“砒 霜制剂治疗白血病问题,早在两千年前我国已经对砒
霜的药用价值及毒性有一定认识,在古人经验基础上,近代科学家又进行了深入的研究
,发现砒霜(三氧化二 砷)及青黛、雄黄(二氧化二砷)组成的“青黄散”可以治疗
白血病,其后进一步将砒霜精制成三氧化二砷制剂,又经一系列制剂学、药理毒理学及
大量临床试验, 证实对白血病确实有疗效,陈竺院士及其夫人等专家对其作用机制作
了高水平的研究并有重大发现,得到国内外学术界的公认,使这个药在世界推广使用”
这样的说法,恐怕陈竺和陈赛娟都受不了。
我相信,陈竺和陈赛娟都不会认为自己是发现砒霜治疗白血病的最大功臣,他们肯定同
意我的写法(见http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-478156.html),毫无争议的最大功臣是:张亭栋。
如果到今天,连研究中药的李连达都不清楚事... 阅读全帖
x********e
发帖数: 2275
28
来自主题: Biology版 - 包子,求一篇文章
请发到:h******[email protected]
先谢过了!
Curr Med Chem. 2012 Dec 1;19(35):6065-71.
Characterisation of a Neural Teratogenicity Assay Based on Human ESCs
Differentiation Following Exposure to Valproic Acid.
Colleoni S, Galli C, Gaspar JA, Meganathan K, Jagtap S, Hescheler J,
Sachinidis A, Lazzari G.
SourceAvantea, Via Porcellasco 7/f, 26100 Cremona, Italy. silviacolleoni@
avantea.it.
Abstract
The development of in vitro testing strategies for chemical and drug
screening is a priority need in order to protect... 阅读全帖
r*******y
发帖数: 48
29
来自主题: Biology版 - 问个NOTCH-HES1方面的问题
1. 我没有做的很细致,但是我看到了dnHes1能antagonize WT Hes1 induced promoter
activity.
That is good;
2. 保守的序列我已经做了突变,但是仍然能看到WT Hes1的激活作用,因为有好几个
potential Hes1 binding sites,所以我不能排除其它的位点不起作用。我现在在做
truncation mutation,想找到Hes1 responsive element。
how long of this promoter you tested? mutation of that conserved binding
site resulted in how much percentage of reduction in its activation compared
with that of the WT promoter by Hes1? in most cases,it w ill not be only
one site that contributes 100% to that activation... 阅读全帖
s********n
发帖数: 2939
30
只是猜测:你这种情况可能像ls有人提到的,形成A-B active complex比较复杂,或者
不稳定,易形成aggregation。可以试试,
1)in vitro reconstitution, 用很低的浓度做试验(ug/ml);A和B在高盐浓度下的
稳定性如何?如果稳定的话,你可以试试在高盐(1 M even higher)条件下做混合,
高盐可能可以降低non-specific interaction形成aggregation的几率;
2)in vivo,你可以试试用weak promoters表达你的蛋白(Aw+Bw, Aw+Bm, Am+Bw; w,
weak, m, medium),lower temperature,coexpress chaparones。
不过个人更倾向于试in vitro的方法,in vivo的local concentration太高了即使在
low expression的条件下。
BTW: Chaperone的plasmid可以买Takara (Clontech)和Agilent (Stratagene).
s***e
发帖数: 911
31
其实试验上最近突破挺大的。最近有两篇文章几乎同时出来(PNAS; Naure
Communication), 关于in vitro formin如何感应力并调控actin生长速度。不知道你看
到没有。in vivo 也有很大进展。Sheetz组现在能够直接in vivo 测量 focal
adhesion protein的end-to-end distance. 其中talin的工作去年已经发表在PLoS
Biology上。 今年会有一系列别的蛋白的结果出来。会非常有趣。
in vitro adhesion protein如何感受机械力,如何unfold, 如何因此和别的signaling
protein相互作用把机械力信息转化成生化反应信号传递,今年会有一系列工作出来,
包括talin-vinculin, alpha-actenin - vinculin, 等。
上面这些全部都是直接单分子测量,和模拟无关。 我觉得你说得挺对的。这个方向似
乎很快就会有很大突破。
y*****w
发帖数: 1350
32
I think it's a different scenario than HIV. Here what is risky is the T-ALL
gene itself, not the retrovirus that takes the T-ALL gene, whereas what is
risky in HIV is the HIV itself. That's why HIV has to be transmitted in vivo
to keep its infection ability, and any time longer than 1/2 hour of it being
in an in vitro environment will cause its "death" and loss of infection
ability. Here, it doesn't matter how long the needle that carries the
T-ALL-retrovirus-containing mouse blood stood alone ... 阅读全帖
l******u
发帖数: 936
33
http://investor.illumina.com/phoenix.zhtml?c=121127&p=irol-news
Illumina’s MiSeqDxTM Receives FDA Premarket Clearance with Two Cystic
Fibrosis Assays and Universal Kit for Open Use
Premarket Clearance is an Industry First for a Next-Generation Sequencing
System
SAN DIEGO--(BUSINESS WIRE)--Nov. 19, 2013-- Illumina, Inc. (NASDAQ:ILMN)
today announced that it received premarket clearance from the U.S. Food and
Drug Administration (FDA) for the MiSeqDx system, the first high-throughput
DNA sequencin... 阅读全帖
j****x
发帖数: 1704
34
HBV infection是否存在cell-cell contact mediated direct transmission的机制,
目前尚无定论,现有的in vitro model的数据似乎并不支持但也无法完全排除这种可能
。然而entry inhibitor确实可以有效阻止viral spread in vitro and in vivo,那么
合理的猜测就是即便存在细胞间的传播,也很可能是经由受体介导的。
hepatocyte的再生比较特殊,即便是成熟的肝细胞本身仍然具有很强的增殖潜力,此外
也存在liver progenitor cells。但有证据表明,HBV只感染高度分化的肝细胞,原因
之一就是NTCP只在分化的肝细胞中高表达。理论上讲,如果能激活肝细胞再生,同时抑
制病毒复制尤其是new infection,是有可能通过“稀释效应”最终清除viral
reservoir的,当然这仍然需要相当长的时间彻底清除病毒,很难像HCV DAA治疗那么强
效。
h*******o
发帖数: 4884
35
in vitro or in vivo?
in vitro it is easy
You can use hexokinase inhibitor, such as 2-deoxyglucose,
You can use PDH activator, such as dicholoracetate
You can use Pyruvate transporter inhibitor, Thiazolidinediones
There are so many ways to manipulate cellular bioenergetic flux (glycolysis
or Mitochondrial OXPHOS), some may require digitonin or other similar
detergent to permeablize plasma membrane.
g********6
发帖数: 86
36
in vitro: 细菌表达GST融合蛋白,做GST pull down,可以用你提到的in vitro
transcribed rRNA,33P标记,完了之后做液闪。
in cell lines:转染HA/FLAG标记的蛋白表达质粒,做RNA immunoprecipitation,然
后做qPCR或RNA-seq。前面有人提到用CRISPR敲进标记,我觉得可能比较麻烦,不如用
质粒来的简单。当然最可信的方法还是用目的蛋白的抗体。
m*********D
发帖数: 1727
37
来自主题: Biology版 - 柳暗花明
下班前被老板叫住,到他的办公室,他有重要事情告诉我:去年送出去的三个proposal
,一个去年就被拒了。今天另一个的消息来了--三年,60万左右的经费!又有三年不用
担心工作了,也离我55岁可以退休的日子不远了--Get the monkey off my back!
这个药物筛选的项目有十年了。记得十几年前来试验室的一个Ph.D./M.D.学生作腻了用
gel shift的方法来检测蛋白质和DNA结合,改用旋光方法来分析,方法发表在一个三流
杂志上。老板破天荒第一次从基因表达调控的理论研究转向药物筛选的应用研究,把一
个药物筛选的方法的proposal送进了NIH,拿到了三年的经费。他有些不舍,给我说:
大多数顶尖科学家还是冲诺贝儿奖,喜欢搞理论的,我们这个转向也许是对的。
三年时间,我把一个旋光检测蛋白质(transcription factor)和DNA结合的方法
develop成High Throughput Screening(HTS)。刚接手的时候,看到同类型的文章已经
出来--证明了in vitro筛选出来的compound在细胞水平是不起作用的。当时拿着人家文
章和老... 阅读全帖
j*********j
发帖数: 124
38
我们试了IMPACT™ Kit,可以得到想要的氨基酸序列(没有任何tag,不用从Met
开始)。但是得率不好。
有个 PURExpress® In Vitro Protein Synthesis Kit, 但是不知到这个好不好
用?听说in vitro大多时候都不好用。
c********n
发帖数: 67
39
来自主题: Biology版 - Paper help, thanks a lot
Surgical treatment for tubal disease in women due to undergo in vitro
fertilization
Transvaginal ultrasonic needle guided aspiration of pelvic inflammatory
cystic masses before ovulation induction for in vitro fertilization
Evidence-based diagnosis and management of tubal factor infertility
Tubal factor infertility: diagnosis and management in the era of assisted
reproductive technology
Tubo-peritoneal factor of infertility: diagnosis and treatment
Tubal disease and fertility outcome
A reassessm... 阅读全帖
S*****s
发帖数: 242
40
最早发现Ctla-4的是James Allison?这是谁告诉你的?Pierre Goldstein!连ctla-4
对免疫的抑制功能都是Jeffery Bluestone发现的,这才是关键的发现。这个Jim
Allison是开发抗体的,这个credit要给他。不过这离Lasker也太远了吧? James
Allison现在是拉上他在MD Anderson的情妇拼命的抢credit,故意误导舆论。这不就有
像你这样被误导成了义务宣传员的? 建议好好阅读这篇新的Science Letter, 搞清楚
才发言。
https://www.sciencemag.org/content/344/6180/149.1.full
Science 11 April 2014:
Vol. 344 no. 6180 p. 149
DOI: 10.1126/science.344.6180.149-a
LETTERS
Immunotherapy: It Takes a Village
We in the cancer immunology and immunotherapy community are th... 阅读全帖
l****5
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41
来自主题: Biology版 - paper helps!
谢谢 。没有 什么包子了。只能 说声 谢谢。请帮忙发g***********[email protected]
1) Glucosinolates in Brassica foods: bioavailability in food and
significance for human health
2) In vitro activity of glucosinolates and their products against
Leptosphaeria maculans
3) A review of mechanisms underlying anticarcinogenicity by brassica
vegetables
4) Total and individual glucosinolate contents in inflorescences of eight
broccoli cultivars grown under various climatic and fertilisation
conditions
5) Myrosinase-genera... 阅读全帖
t**l
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来自主题: Biology版 - Li-huei Tsai又灌了一篇cell
我不太同意。我认为用293T做出来的东西就是偷懒。
我见过有人发的文章,MOUSE MODEL 不仅有cre lox KO 模型, 还有GFP reporter, 有
Biotin-tag,有磷酸化氨基酸位点突变。 从头到尾一个cell line也没用,照样把IN
VIVO的机理在IN VIVO里面做出来。
如果起点是一个IN VIVO的模型,结论也是IN VIVO的,中间一堆都是IN VITRO cell
line出来的,那种文章看着就欠火候。
如果是IN VITRO起点,最后用IN VIVO验证一下,还算可以。

vivo
l**********2
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来自主题: Biology版 - Postdoctoral position open
Anybody interested in the following position, pls contact with Dr. Scott or
contact with me ( [email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=document.createTextNode(s);l.parentNode.replaceChild(s,l);}}catch(e){}})();
/* ]]> */
) to get some information about
the... 阅读全帖
D*a
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来自主题: Biology版 - Doug Melton分化出来人beta细胞了
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867414012
Here, we report a scalable differentiation protocol that can generate
hundreds of millions of glucose-responsive β cells from hPSC in vitro.
These stem-cell-derived β cells (SC-β) express markers found in mature β
cells, flux Ca2+ in response to glucose, package insulin into secretory
granules, and secrete quantities of insulin comparable to adult β cells in
response to multiple sequential glucose challenges in vitro.
w*********o
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来自主题: Biology版 - 坏消息,求安慰
I am not sure. It might still doable unless your current funding is through
this mechanism already. 14-279 covers:
"In vitro cellular and tissue activities (potency, selectivity, specificity,
etc.);
In vitro structural, physicochemical, and biochemical properties (solubility
, stability, membrane permeability, protein binding, microsome stability,
metabolite identification, CYP inhibition, etc.);
In vivo pharmacokinetics (PK) with absorption, distribution, metabolism,
excretion (ADME) and toxici... 阅读全帖
c******9
发帖数: 8
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安特诺生物医药(厦门)有限公司是厦门市第三批“双百”创业、创新领军人才、
外籍归国博士于2012年12月成立的中外合资公司,落户于厦门火炬创业园。公司主要从
事肿瘤监测和免疫治疗相关的实验和临床研究,提供从美国引进的专用于评价肿瘤治疗
效果与转移程度的“循环肿瘤细胞检测”服务,是一家集科研与检测服务于一体的生物
高科技公司。公司核心研发科学家和管理人员均为生物医药领域具有几十年工作经验且
具行业权威性人物。
2013年底,因公司发展需要,整体搬迁至厦门火炬(翔安)产业区,并投资新建了
国家级标准化的GMP实验室。
目前,公司与厦门大学药学院转化中心建立了项目合作关系,成立了厦门大学药学
院安特诺细胞医药研发中心,并与多家三甲医院开展临床科研与应用研究。
公司正处于全力发展阶段,诚邀从事肿瘤免疫学、免疫学方面的有志之士具有博士
及以上学历者加盟,负责实验室研发及管理。我们的科研、管理团队将为您提供良好的
专业发展机会。对于入聘人选,公司将提供良好工作环境与丰厚的福利和薪酬待遇。

工作地点: 厦门市翔安区厦大药学院
薪酬范围:US$ 30,000-40... 阅读全帖
c****c
发帖数: 36
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来自主题: Biology版 - 请教关于蛋白质的酶活性研究
你那个蛋白有没有selective的inhibitor,如果有,加到lysate里试试看
要不然RNAi knockdown看活性有没有降低
纯化的蛋白就是有一点,你in vitro的量不一定真正代表endogenous level,所以in
vitro work了以后你还是要knockdown或者knock out了再测
z******n
发帖数: 97
48
来自主题: Biology版 - 结构生物学到底有什么用
从化学药研究的角度来说,实际价值不一定很大,对于SAR的建立有一点辅助作用,对
提高in vitro 活性也许有帮助,也有可能误导。其实,新药研究在进临床之前最容易
的就是达到in vitro活性,后续的工作才是困难所在。
[在 Ka84 (无) 的大作中提到:]
:结构和蛋白序列,基因组序列,基因表达数据一样,属于生物数据的一种,至于你说
他有多重要,取决于你是否用它。比如很多生化实验,需要用结构来指导。比如tet1的
鉴定,你以为tet1最初怎么预测出来的?再者很多生物过程的精细分子机制往往要通过
结构来确定,毕竟生化和遗传结果不可能面面俱到。总之,这是生物研究的一个方面,
也是一个方法。

:...........
l*******r
发帖数: 407
49
来自主题: Biology版 - 中药的科学研究丰碑-饶毅
http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=2237&do=blog&i
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至... 阅读全帖
n**e
发帖数: 2026
50
【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: nile (nile), 信区: WaterWorld
标 题: 美国科学促进会《科学》大旗下的转基因谎言
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Oct 30 10:18:45 2015, 美东)
今年初,美国科学促进会(AAAS)和皮尤研究中心(Pew Research Center)联合公布
的一项调查显示,88%的科学家认为转基因食品可安全食用,持这一看法的公众只有37
%。报告认为差距如此之大的一个可能原因是,三分之二的公众认为科学家对转基因食
品的健康后果没有清晰认识。这就是真正的原因吗?
根据报告全文,皮尤中心给19,984名科学家发出了调查问卷,3748人(18.8%)完成了
问卷调查。其中生物医学学科背景的科学家占50%。报告没有说明50%的生物医学背景是
否能够代表科学家总体的学科构成。更大问题是在这50%的科学家人群中,有多少人的
工作是与转基因作物的研究有关,以什么样的方式相关。报告没有提供任何信息。
由于这些关键信息缺失,88%的科学家相信转基因安全的说法毫无意义。在一个没有代
表性并且无法排除... 阅读全帖
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