y****g
发帖数: 36950 | 1 【 以下文字转载自 Dreamer 讨论区 】
发信人: Dreamer (不要问我从哪里来), 信区: Dreamer
标 题: 洗碗不晾干，第二天碗里剩下的水里会有很多残留细菌嘛？
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 11 23:40:10 2014, 美东)
有人做过研究不？老婆洗完碗就收到柜子里，从来不放到台面上的架子里沥干。第二天
盛饭菜时我还要把里面集水倒掉，感觉就是细菌培养液啊。有时我要拿开水烫烫，是我
有洁癖还是老婆不懂卫生？ |
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H********g
发帖数: 43926 | 2 F质粒又叫F因子，为fertility factor（致育因子）的简称，是在大肠杆菌等细菌中发
现的一种最有代表性的单拷贝的接合型质粒，其决定性别并有转移功能。
F质粒是雄性决定因子，因此带有F质粒的细胞为雄性细胞，与此对应不含F质粒的为雌
性细胞。带有F质粒的细菌有性菌毛（每菌仅为1-4根）。 |
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g***t
发帖数: 7544 | 4 只要停止使用抗生素半年，这些超级耐药细菌就会被不那么耐药的同种细菌淘汰。 |
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c******s
发帖数: 270 | 5 网上搜了一下貌似说寄生虫冷冻24小时以上可以杀死，细菌可能不完全，但是健康猫狗
可以承受少量细菌 |
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N******t
发帖数: 16051 | 6 grind的好处是确保每样成分都吃进去了，如果不挑食，切成块喂也可以
我有这个，不过不是特别好用，最近都用切块的；将来有钱了可能会进electric
grinder
http://www.amazon.com/Norpro-Grinder-Mincer-Pasta-Maker/dp/B000
配方简单来说就是80％肉（需要一些肥肉比如带皮鸡腿），10％骨头，10％内脏一半心
一半肝，再加上维生素BE鱼油海藻水和一点点磨碎的蔬菜
冷冻可以解决寄生虫的问题；为了控制细菌，不要买绞好的肉，绞过之后要立刻冷冻起
来，绞之前也可以用开水烫一下表面
（另外-80C 冻细菌要加glycerol的阿。。。。。。。不然也冻死了吧）
家禽类的小骨头，比如鸡肋骨或者鸡翅膀，都是不错的骨头来源；不要给任何承重骨
如果不用骨头，也可以用钙或者其他替代物；不过如果用熟的bone meal，有点defeat
the purpose of raw feeding；最理想是冷冻的ground raw bone，不过我土人不知道
去哪找
也可以直接买commercial raw food；我做过计算比喂好的罐头稍微贵一点... 阅读全帖 |
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Z**i
发帖数: 5681 | 7 猫狗有盲肠的，就是用来对付细菌的。
对我们有害的细菌，对他们大多数时候没事。 |
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m*******g
发帖数: 7050 | 8 本着科学的严谨态度，我要提几个问题
1. 有没有证据证明，cat litter box有更高的几率传播T. gondii？如果没有证据，那
就是说，任何东西的传播几率都是一样的，那你还着急个p
2. 有没有证据说明，传播的媒介是什么？如果媒介是因为不干净的手......那跟cat
litter box又有什么关系？
3. 有没有比较数据证明，T. gondii引发的精神疾病比其它感染要高？说不定发烧引起
的精神疾病是200%？谁不发个烧什么的，那你还着急个p
其它各种，不一一列举
作者的论证手段是：cat litter box会携带细菌 -- 细菌通过媒介传播T. gondii --T.
gondii会有后遗症 -- 后遗症会引发精神疾病。所以cat litter box会引发精神疾病
那是大脑有多大问题的人才能进行那样无厘头的论证啊～～～ |
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e********r
发帖数: 147 | 9 在细菌里做，打算用超离心分别分离外膜、周质和细胞质蛋白，然后用Western杂交，
这个策略分析蛋白定位的问题会遭到审稿人的反驳吗？感觉好象细菌里用GFP来定位的
研究不是很多啊，不象在真核里只要说定位，好象就是GFP似的？ |
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R*****o
发帖数: 14902 | 10 我可以证伪你这个假设。我把海洋细菌1拿来和日本肠道细菌2混养，一段时间以后，看
是否
lateral gene transfer. |
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H***e
发帖数: 223 | 11 我想到的方法是：
1）PCR基因的3'和5’端的两个片段；
2）PCR一个抗性标记；
3）把抗性标记连接在两个片段中间；
4）把整个片段连在一个质粒上，转到细菌中；
5）涂带抗生素的平板筛选基因缺失的细菌。
请问这样做可以吗，如果缺失的是一个house keeping gene还能这么做吗。
盼有经验的同学能站内信教我一下，谢谢。 |
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o******n
发帖数: 511 | 12 背景：
1. 有个酶能分解一种底物，其产物可作为细菌的唯一氮源。这个酶连带它上下游
flanking region一起放到质粒上，转到大肠杆菌里，大肠杆菌可以表达这种酶，别人
测过cell-free extract里的酶有活性。
2. 已知这种酶Km比较低，对底物亲和力低
3. 土壤细菌本身有这个酶的，在minimal media+底物的平板和液态培养基都可以长起
来，长得慢。
4. 大肠杆菌好像不太喜欢这个6 kb多的质粒，每次overnight culture都长得不太浓，
有floc,显微镜下看到细胞连成长条，肉眼可见细胞沉在管底。
现在我在minimal media+底物的液态培养基里想长带这个酶的质粒的大肠杆菌，就是长
不起来，我试了几种minimal media，加了trace elements，也不行。大肠杆菌在
minimal media加别的氮源可以长。
因为酶不给力吗？可是再怎么不至于一点都长不起来呀？换个很强的promoter，多产些
酶有用吗？
还是因为酶在质粒上，而大肠杆菌不喜欢这个质粒，在minimal media里，就不爱给表
达它了？
请大家给些建议意见... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 13 正在看。
她们认为该细菌仍然是用DNA system, 唯一不同的是磷被砷代替了
因为：
１。该细菌可以在没有磷的培养液里生长
２。提取出来的DNA含有大量的砷 |
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s********n
发帖数: 2939 | 14 虽然细菌很能适应不同的环境，但这么根本性变化还是可能性很小的。上面的原文就提
出原始的地球环境比较多砷，可能以砷作为基础，然后进化成用磷的生物，如果是的话
这个细菌就可能是化石了，既可以用砷也能用磷。当然一切都需要下一步的研究才能知
道了。
变。
变。 |
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S******G
发帖数: 965 | 15 我看了觉得大家激动太早了。报道只是说细菌能在高浓度的砷里面存活，现在有任何证
据表明遗传物质里面的磷被砷取代吗？如果是取代了，是全部被取代还是部分被取代了
？如果是部分被取代了，是那些部分呢？
RNA和DNA就像化学里面的催化剂，有的反应需要很大量的催化剂，有的反应只需要几个
ppm的催化剂。也许这种细菌的机制是对自身的遗传物质的保护很好也未可知。或者这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的ATP，它只需要1ppb。
我瞎说哈，还是你们生物学家接着聊。 |
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s********n
发帖数: 2939 | 16 1. 好氧细菌（16S rRNA鉴定）；
2. 不是严格的嗜砷生物（not obligate arsenophile）；
3. 此菌在磷存在的条件下生长得更好；
4. 在As+/P-的条件下，细胞中还是含有一定量的磷（从试剂中带入），但砷大概是磷
的7.3倍（文章中显示砷的测定不是很准确），而且此数量的磷据推测不足以满足细菌
生长的需要；
5. As+/P-条件下生长的细胞比As-/P+条件下生长的细胞大，主要是由于产生了PHB；
6. 作者通过实验证明As分布在细胞的各个部分，包括DNA, RNA, protein, lipids和
metobalites（放射性深和磷的分布）;
7. 作者讨论提到尽管含As的代谢物尽管相对于P而言很不稳定，但他们推测此菌有一套
应对的方法，比如说利用PHB的疏水环境。 |
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c*******y
发帖数: 161 | 17 各位朋友，我刚开始接触生物信息，想对两株细菌的全基因组序列和蛋白质序列进行比
对，找出两株细菌之间的差别，有哪位朋友知道什么软件可以解决这个问题，并请说明
一下具体怎么安装、怎么使用?多谢了,我的邮箱g***********[email protected] |
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k***g
发帖数: 4904 | 18 只是普适性的对样品板上存在的细菌（2um左右大小的）进行染色，然后进行显微镜观
察，用什么方法最为方便？有染料可以无差别的对各种细菌进行染色，达到足以显微镜
目测的程度吗？用荧光染色的话，最方便廉价的方法是什么呢？谢谢啦！ |
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m**********2
发帖数: 6568 | 19 傻逼们的共同之处就是把自己的全部观点都建立在这个基础上
“据我回忆，当时中国的抗生素只有几种：青霉素，红
霉素，土霉素，庆大霉素，四环素等。 中国十亿人口，连同世界几十亿人，至少在八
十年代之前，得病了如果要用抗生素，只有那几个选择。而且几十亿人口，大批量地，
连续地用了几十年，到八十年代末，我还没听说”
“据我回忆。。。。。我还没听说。。。。。。”
随便找个微生物学专业的就知道，70年代80年代中国都有关于细菌抗药性的研究；随便
学点临床微生物学都知道中国早就有抗药细菌。
把自己的无知作为基础，建立巨大的理论并且忽悠同样的无知且逻辑推理能力更低的人
，就是这些人的共同点。 |
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A********2
发帖数: 107 | 20 头孢确实比青霉素要安全很多，而且更广谱，但是正是因为广谱才会造成抗药的增加，
理论上最好的抗生素是针对所感染细菌的种类使用窄谱的抗生素，这样能减少抗药性的
产生。抗药性的问题越来越严重，当然对免疫力正常的人来说威胁很小，但是对老人和
体弱的人来说就是大问题了，比如有些抗癌药物不能用就是因为会损伤免疫力。我也只
能是猜测，因为本身也不是医生，不知道医院里面老人和免疫力弱的病人（比如做移植
手术）有多少死于细菌感染但是一线抗生素无效的。 |
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j****x
发帖数: 1704 | 21 所谓广谱窄谱都是相对的，广谱也不是产生耐药性的原罪，只要使用得当，广谱抗生素
显然可以“扬长避短”，而窄谱的抗生素一样存在耐药性问题，并非因为广谱才会导致
耐药性增加，所以避免长期过量使用的原则对二者均适用。同时在实际运用中，使用前
的耐药性检测也是越来越普及越来越受到重视的常规，这是很好的趋势。
目前已知的NDM-1“超级耐药细菌”的致病力很弱，而且不会在人间传播。未来是否会
出现你所担心的高致病性高耐药的真正超级细菌，确实不好说，这玩意应该是生物武器
的绝好材料。 |
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k***g
发帖数: 4904 | 22 先说一下问题背景：没有生物背景的在使用细胞做实验。。所以希望大牛能给我扫盲一
下。。
原来在用Celltracker Orange，$225/1mg, 稀释到5ug/mL使用。似乎working solution
不能储存太长时间，而且最近快用完了，考虑有没有更便宜，操作也简单的染料，替换
这个Celltracker Orange。最好是488nm左右激发的，可以有更多显微镜可以用，不过
别的波长的如果很便宜又好用也可以考虑。做的细菌有革兰氏阳性和阴性的，希望这个
染料就是随便什么细菌都可以染，而且基本保持细胞活性，最好不改变细胞膜状态，而
是钻进膜后固定在细胞内，可以维持一段时间荧光性能。请问有什么染料可以推荐的吗？
多谢多谢了！ |
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h**********r
发帖数: 671 | 23 差不多是这样的，还要看你要做啥细菌。
有的细菌抗拒这种同源重组
google一下suicide plasmid之类的
可以做knock out,knock in
还能利用marker负选择把抗性基因给去掉 |
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m*****j
发帖数: 144 | 24 打算用2种不同荧光蛋白标记2种不同的细菌，然后看它们的互作关系。目前，有一种细
菌已经被GFP标记了（用GFP-vector转化到这种细菌里面），现在的问题是 是不是还得
用同样的方法制作第二个荧光标记菌？有没有其他比较简单快速的方法呢？而且买荧光
标记质粒好贵啊。 |
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F*Q
发帖数: 3259 | 25 大多数细菌是通过binary fission来产生新个体的，其中对fission起主要作用的一个蛋白质叫FtsZ。同时有些细菌(alpha-proteobactria)是通过budding来产生新个体的，我想知道是哪个或哪些蛋白或基因对budding起主导作用。有人知道相关信息吗？
切题的回复有包子答谢 |
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I***a
发帖数: 13467 | 26 Caulobacter是你说的budding细菌之一，
差不多就是用Ecoli那一套东西。
挺有意思的，
2分裂菌用的东西，难道budding的就不能用？
只不过细节有点差别而已。
有多少细菌能逃脱fts,min,par 这几个系统， |
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l**********1
发帖数: 5204 | 27 cdvC or cdvA gene:
cdvC
Nitrosopumilus maritimusmmi
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21923770
cdvA:
Caldiarchaeum subterraneum
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21169198
details please refer
Swedish Uppsala Univ PhD thesis 2012:
full text link:
//uu.diva-portal.org/smash/record.jsf?pid=diva2:464718
its pp25
Yet another indication of essential
gene function comes from production of gene knockout mutated cell lines.
Attempts to delete the cdvC gene have not been successful (Hobel et al.,
2008). While neg... 阅读全帖 |
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F*Q
发帖数: 3259 | 28 真的很感激你热心提供的信息！Cdv 蛋白也许在budding细菌中有homolog，但毕竟不是
在细菌里做的，所以对我还说还是远水解不了近渴啊。似乎你做的就是相关的领域的东
西，如果有兴趣，我们可以私下聊聊，看是否有可能合作。 |
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e**r
发帖数: 1144 | 30 一盘污染的细胞
发现很多细胞里有很大的囊泡，里面充满细菌
应该不是衣原体，因为在LB上可以长
还有哪些细菌可以在囊泡里复制吗？ |
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c*********r
发帖数: 181 | 31 正在做土壤古细菌鉴定，DNA已经提取出来了，现在用了一个文献的方法用巢式PCR扩增
16SDNA，但是一直不成功。用别的文献方法，别的引物能够扩增出来条带，说明里面应
该是有古细菌DNA的。
我用的文献方法是：cindy H. Nakatsu (2000): soil community analysis using
DGGE of 16S rDNA Polymerase Chain reaction products.
请教各位大仙，能否给我一点指导？
谢谢！ |
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A*******e
发帖数: 284 | 32 别的引物是啥引物？ 要不是古细菌特异引物， 十有八九扩出来的是真细菌。 |
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M*******n
发帖数: 10087 | 33 转过来是为了问两个问题：
1.这个细菌如何能感知白细胞存在方向以至于总是朝对的方向逃逸？
2.白细胞又如何感知细菌存在方向，总是能紧追不舍？ |
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g***j
发帖数: 40861 | 34 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: oct4 (hi), 信区: Military
标 题: 超萌的白细胞捕捉细菌以及袖手旁观的红细胞 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 4 15:20:15 2012, 美东)
发信人: platinumegg (蛋,纯铂金的), 信区: Joke
标 题: 超萌的白细胞捕捉细菌以及袖手旁观的红细胞
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 4 12:49:55 2012, 美东) |
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k***g
发帖数: 4904 | 35 不管死活，如果细菌在当初培养的那片gel plate上，gel还没干，那细菌的形态会发生
什么变化？会溶解掉吗？如果镜下看到形态还是完整的，细胞膜表面是不是也不见得有
很大变化呢？请大牛给扫盲一下，非常感谢！ |
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d*****n
发帖数: 166 | 36 有的细菌蛋白结构都拿了炸药奖了。不要鄙视细菌。 |
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b******1
发帖数: 1116 | 37 以前学的细胞生物学，微生物学都换给老师了。。。求解答一下概念
1）细菌的菌种鉴定中，“细菌基因组DNA抽取”， 这个DNA是不是指核糖体DNA （rDNA
, Ribosomal DNA）？ 还是任何细胞内的DNA？
2）DNA抽取后采用PCR扩增，获得DNA序列 - 16S基因DNA，那这个16S基因DNA是特指
16s rDNA序列？还是只能用16S基因DNA这个笼统的表达方法？
3)扩增的是16s rRNA还是16s rDNA? |
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k***g
发帖数: 4904 | 38 Calcein, AM
这个用在细菌上能只染活的么，效果如何
dye
400 |
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m***u
发帖数: 39 | 39 楼上正解。这个解析一个细菌膜蛋白结构是突出贡献，但这个和铲除“超级细菌” 没
有什么必然的关系，完全是在误导和夸大 |
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k***g
发帖数: 4904 | 40 如果加了药后在细菌培养液里面检测到遗传物质，是不是可以说细胞膜一定有了defect
跟别人上课讨论个问题，想来求证一下，如果细菌培养液加点药，破坏膜完整性那些，
是不是有可能漏出一些RNA来呢？DNA有可能漏出来吗？谢谢！！！ |
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d**********6
发帖数: 4434 | 41 细菌病毒入侵到宿主以后引发疾病，宿主会死去，然后细菌病毒自身也会死去。
那么他们存在的意义到底是什么，他们活着的目的就是让别人死去然后自己也死去？ |
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d**********6
发帖数: 4434 | 42 从生物圈的角度来看，细菌病毒当然产生了筛选器的作用。但这个作用更像是一个被设
计出来的机制，这种机制对细菌病毒来说，似乎不大符合他们种群的自身利益，不像是
一个进化出来的物种。 |
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T*****e
发帖数: 247 | 43 你问的是一个根本性的大问题，我觉得很难回答，我也不觉得即使是我们一般的生物专
业的人能清楚的回答你的问题。也许有一些同行有深入的认识，但是我没有。不过我觉
得你的问题的范围太宽泛了。应该限制为生命某个阶段有寄生行为的细菌或者病毒对该
特定细菌或病毒的繁衍有什么明显的益处。或者说为什么会出现寄生？
答案很简单，因为这个世界上所有的生命都要占据一定的生态位（biological niche）
。而已有的生命体作为一个具有稳定新陈代谢的系统，能从外界不断获得新的能量和物
质，这本身就是一个最好的生存环境（相对寄生物而言），很难想象在漫长的进化过程
中没有任何生物尝试进驻这样的生存环境，占领这样的生态位。
因此我大胆提出一个猜想：生命体个体的生存时间（life span）越短，被寄生的可能
性越低。
欢迎大家挑战我这个猜想。 |
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s*****i
发帖数: 315 | 44 人的基因组里有很多已经死了的病毒序列，病毒在进化上是有意义的。再说不致病的病
毒也不易被人重视，这就是你得到没有益生病毒结论的原因
大部分细菌也不以人和动物为宿主，土里面细菌多了，没有他们地球上就尸体遍地了
总而言之，基础知识不够
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7 |
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w*****y
发帖数: 1201 | 45 致病细菌在总的微生物种类里只是一小部分，微生物在大部分宿主出现在地球之前就已
经存在了。
致病性细菌应该是在各种宿主进化过程中产生的，病毒是一个很难解释的现象，觉大部
分发现的病毒都是致病性非常强的，病毒繁殖的最终结果就是mutual destruction. |
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j******i
发帖数: 939 | 46 最早的免疫疗法就是用细菌 是100多年前的事情了 当时有个医生注意到有些肿瘤患者
感染细菌后肿瘤消失了 于是用来治疗病人 后来逐渐被化疗放疗取代 这几年也一直不
愠不火 虽然上了临床 但是没有观察到效果 以后的方向是基因改造或者联合其他疗法
现在免疫疗法上最靠谱的还是CAR-T, check-point inhibitor以及HSV溶瘤病毒。 |
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j******i
发帖数: 939 | 47 这个文章能发Science 是抓住了PD-L1抗体这个热点 细菌引起肿瘤自发消退这个现象
100年前就观察到了 临床应用一直效果不佳 或者因为细菌毒性被迫中止 黑色素瘤的免
疫性很强 随便注射点细胞因子都会有反应 |
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q**********0
发帖数: 335 | 49 谢谢回复！
细菌mRNA也是Polyadenylated的吧？过Poly-T的柱也会跟着一起下来的。 |
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s****6
发帖数: 34 | 50 这在分析时用不同的参考基因组和GTF文件，人的和细菌的应该差异很大，估计不需要
分别做文库。 |
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