C*****h 发帖数: 926 | 1 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%),
不知道是怎么回事?
0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine
转染1x10^5细胞。
不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果?
我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质,
看目标蛋白是不是减少了。
可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown,
总个western blot还剩下99%的蛋白质。
有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。 |
s******y 发帖数: 28562 | 2 我用的是embryonic fibroblast, 和3T3差不多。
一般都能做到20%。 再高就没有办法了。
基本上,你要确认两件事:
1。你提的DNA足够纯。如果不放心的话,可以用ethanol/NaAc 沉淀法
纯化一次
2。细胞的状态。 必须在60~80% confluence 之间。
如果都不行的话,还有一个不是办法的办法,
那就是把细胞trpsinized, wash, resuspend, 然后在细胞贴壁之前
把转染混合物加进去。因为细胞在spread and adhere 的时候会吸进很多
vesicle.相当于就是强行把DNA弄进去了。不过这个方法会弄死很多细胞。
谢。
【在 C*****h 的大作中提到】 : 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%), : 不知道是怎么回事? : 0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine : 转染1x10^5细胞。 : 不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果? : 我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质, : 看目标蛋白是不是减少了。 : 可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown, : 总个western blot还剩下99%的蛋白质。 : 有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。
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l*********i 发帖数: 10 | 3 用fugene转(英文名字忘了拼写了)。lipo毒性太大,
谢。
【在 C*****h 的大作中提到】 : 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%), : 不知道是怎么回事? : 0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine : 转染1x10^5细胞。 : 不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果? : 我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质, : 看目标蛋白是不是减少了。 : 可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown, : 总个western blot还剩下99%的蛋白质。 : 有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。
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T****r 发帖数: 4006 | 4 shRNA vector有puromycin selection? 用药晒一下...
不然就用lentiviral shRNA vector, 直接做成virus 转染.... |
w******e 发帖数: 1187 | 5 sunnyday zhenshi shiyan baodian ...
【在 s******y 的大作中提到】 : 我用的是embryonic fibroblast, 和3T3差不多。 : 一般都能做到20%。 再高就没有办法了。 : 基本上,你要确认两件事: : 1。你提的DNA足够纯。如果不放心的话,可以用ethanol/NaAc 沉淀法 : 纯化一次 : 2。细胞的状态。 必须在60~80% confluence 之间。 : 如果都不行的话,还有一个不是办法的办法, : 那就是把细胞trpsinized, wash, resuspend, 然后在细胞贴壁之前 : 把转染混合物加进去。因为细胞在spread and adhere 的时候会吸进很多 : vesicle.相当于就是强行把DNA弄进去了。不过这个方法会弄死很多细胞。
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a*****n 发帖数: 2835 | 6 shRNA还是做成virus比较有效,siRNA有专门的转染试剂效率很高
谢。
【在 C*****h 的大作中提到】 : 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%), : 不知道是怎么回事? : 0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine : 转染1x10^5细胞。 : 不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果? : 我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质, : 看目标蛋白是不是减少了。 : 可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown, : 总个western blot还剩下99%的蛋白质。 : 有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。
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a****d 发帖数: 1919 | 7 I use lentivirus to make sure high efficiency of transfection. |
s******y 发帖数: 28562 | 8 没有办法,千老作的太久了,什么试验都作过,什么技术都知道一点,
我现在都想我是不是该出一本试验手册拿去卖了。哈哈哈
【在 w******e 的大作中提到】 : sunnyday zhenshi shiyan baodian ...
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s******r 发帖数: 2876 | 9 你应该开一个公司做试验。
没有办法,千老作的太久了,什么试验都作过,什么技术都知道一点,
我现在都想我是不是该出一本试验手册拿去卖了。哈哈哈
【在 s******y 的大作中提到】 : 没有办法,千老作的太久了,什么试验都作过,什么技术都知道一点, : 我现在都想我是不是该出一本试验手册拿去卖了。哈哈哈
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n******d 发帖数: 1055 | 10 欣赏你
【在 T****r 的大作中提到】 : shRNA vector有puromycin selection? 用药晒一下... : 不然就用lentiviral shRNA vector, 直接做成virus 转染....
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w***a 发帖数: 4361 | 11 试过electroporation么?
俺电转过siRNA到differentiated adipocytes,转完以后细胞挂了一些,但剩下的
knockdown effect可以到80%以上。
谢。
【在 C*****h 的大作中提到】 : 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%), : 不知道是怎么回事? : 0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine : 转染1x10^5细胞。 : 不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果? : 我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质, : 看目标蛋白是不是减少了。 : 可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown, : 总个western blot还剩下99%的蛋白质。 : 有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。
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d****d 发帖数: 214 | 12 In my hands and using TransIT-LT1 from Mirus, the tranfection efficiency of
3T3 cells can be as high as 65% for our GFP expressing reporter plasmid. The
transfection efficiency of 3T3 cells can be as high as 90% using Neon
electroporation system, although only ~20% cells survived the procedure. The
transfection efficiency is derived from flow cytometry data. It could be
lower if you just look at the cells under microscope. |
p******i 发帖数: 1092 | 13 对,病毒最狠,
不过你貌似需要LICENSE和LEVEL II的HOOD?
【在 T****r 的大作中提到】 : shRNA vector有puromycin selection? 用药晒一下... : 不然就用lentiviral shRNA vector, 直接做成virus 转染....
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i***R 发帖数: 663 | 14 我用过电转siRNA,效率可达90% 以上。
操作很简单,就是需要找到有设备的实验室。
谢。
【在 C*****h 的大作中提到】 : 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%), : 不知道是怎么回事? : 0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine : 转染1x10^5细胞。 : 不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果? : 我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质, : 看目标蛋白是不是减少了。 : 可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown, : 总个western blot还剩下99%的蛋白质。 : 有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。
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T****r 发帖数: 4006 | 15 我呆过实验室,只要做细胞的,一般使用的hood都可以操作...
【在 p******i 的大作中提到】 : 对,病毒最狠, : 不过你貌似需要LICENSE和LEVEL II的HOOD?
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w***a 发帖数: 1053 | 16 提高lipo和质粒的ratio,多加点lipo,毒性可能大了些,但是效率会高点。
另外,试试电转,如果还不行就virus吧。 |
C*****h 发帖数: 926 | 17 请看附件上的照片(200x),不知道有多少细胞被转染了?
有没有20%?~100% confluency
0.8 ug Plasmid DNA + 4 ul Lipofectamine 2000
转染10^5细胞。
谢。
【在 C*****h 的大作中提到】 : 用lipofectamine 2000转染3T3细胞,但是transfection效率太低(不到1%), : 不知道是怎么回事? : 0.8 ug plasmid DNA + 2 ul lipofectamine : 转染1x10^5细胞。 : 不知道大家是怎么检测shRNA的knockdown的效果? : 我是把带有shRNA的plasmid,转染到3T3细胞,然后用western blot检测蛋白质, : 看目标蛋白是不是减少了。 : 可是现在转染效率不到1%,就算shRNA把那1%的细胞内的目标蛋白全部knockdown, : 总个western blot还剩下99%的蛋白质。 : 有什么办法提高3T3细胞的转染率?有人转染过这个细胞系吗?请帮忙指教一下。谢谢。
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s******y 发帖数: 28562 | 18 3T3用化学转染法作到这个程度已经差不多了。
提高的余地不多了。
如果你还想更高的话,只能用电转或者病毒了
【在 C*****h 的大作中提到】 : 请看附件上的照片(200x),不知道有多少细胞被转染了? : 有没有20%?~100% confluency : 0.8 ug Plasmid DNA + 4 ul Lipofectamine 2000 : 转染10^5细胞。 : : 谢。
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