m****m 发帖数: 395 | 1 用饱和硫酸铵沉淀了蛋白,完全去除上清液后,PELLET用BUFFER溶解,先用PIPET轻轻
把PELLET打碎成小碎片,然后在37C超声水槽里超声,最后还是有微小的蛋白碎片怎么
都不溶解,测了OD280=2左右,也不算很浓啊,这个浓度的时候这个蛋白一般都是溶解
的,测了PH也没有问题。请问该如何让蛋白完全溶解阿? |
s******y 发帖数: 28562 | 2 Dialyze against your buffer overnight
【在 m****m 的大作中提到】 : 用饱和硫酸铵沉淀了蛋白,完全去除上清液后,PELLET用BUFFER溶解,先用PIPET轻轻 : 把PELLET打碎成小碎片,然后在37C超声水槽里超声,最后还是有微小的蛋白碎片怎么 : 都不溶解,测了OD280=2左右,也不算很浓啊,这个浓度的时候这个蛋白一般都是溶解 : 的,测了PH也没有问题。请问该如何让蛋白完全溶解阿?
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D******9 发帖数: 2665 | 3 yes, you have to remove salt first, I used to dialyze my protein at 4
degree overnight |
m****m 发帖数: 395 | 4 The reason why I didn't dialysis is that my protein is a hydrophobic
membrane protein which is desolved in an expensive detergent. If I dialysis,
the detergent will also go away and my protein will precipitate anyway.
I wonder if there's any other way to concentrate protein except using this
method and centrifuge through a membrane to get rid of the water? The later
is not so efficient, because I see some protein also pass the membrane which
causes loss.
Can we use vaccum dry under low temperatu |
m****m 发帖数: 395 | |
s******y 发帖数: 28562 | 6 这几种方法你都可以试一下。没有哪一个是肯定保险的。
至于说用concentrator会损失蛋白?这个可能是因为你没有选对大小合适
的滤膜。一般来说,滤膜的孔的标定尺寸应该比你的蛋白的真正尺寸小
三倍。比方说30K 的蛋白必须用小于10K MWCO的膜,否则蛋白有可能漏过去。
另外,在dialysis 的时候,你可以在外面的溶液里也放上detergent 啊,
我不明白这个为什么会是问题。而且,一般来说,detergent 在溶液里
会形成微团,所以不会容易的透过滤膜
dialysis,
later
which
【在 m****m 的大作中提到】 : The reason why I didn't dialysis is that my protein is a hydrophobic : membrane protein which is desolved in an expensive detergent. If I dialysis, : the detergent will also go away and my protein will precipitate anyway. : I wonder if there's any other way to concentrate protein except using this : method and centrifuge through a membrane to get rid of the water? The later : is not so efficient, because I see some protein also pass the membrane which : causes loss. : Can we use vaccum dry under low temperatu
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a****o 发帖数: 1786 | 7 如果已经是纯化的蛋白,就不用硫酸铵了吧,这个主要是分离用的
可以用乙醇或TCA, 不知道会不会好溶,没经验 |
a****o 发帖数: 1786 | 8 看来你是赵本山
【在 s******y 的大作中提到】 : 这几种方法你都可以试一下。没有哪一个是肯定保险的。 : 至于说用concentrator会损失蛋白?这个可能是因为你没有选对大小合适 : 的滤膜。一般来说,滤膜的孔的标定尺寸应该比你的蛋白的真正尺寸小 : 三倍。比方说30K 的蛋白必须用小于10K MWCO的膜,否则蛋白有可能漏过去。 : 另外,在dialysis 的时候,你可以在外面的溶液里也放上detergent 啊, : 我不明白这个为什么会是问题。而且,一般来说,detergent 在溶液里 : 会形成微团,所以不会容易的透过滤膜 : : dialysis, : later
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s******y 发帖数: 28562 | 9 小师弟呵,那个三倍的说法是蛋白生化界人常用的。
因为公司们标定那个MWCO 一般是用直链高分子聚合物来测的。
换算成球型分子就必须比这个大三倍,才能保证球形分子的直径是孔径的
1。5倍左右
【在 a****o 的大作中提到】 : 看来你是赵本山
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a***a 发帖数: 40617 | 10 漏也漏不了多少,我用30k的concentrator试着想分离10k的蛋白(可以想让他
漏过去)
结果发现也就20%能过去。。。
【在 s******y 的大作中提到】 : 小师弟呵,那个三倍的说法是蛋白生化界人常用的。 : 因为公司们标定那个MWCO 一般是用直链高分子聚合物来测的。 : 换算成球型分子就必须比这个大三倍,才能保证球形分子的直径是孔径的 : 1。5倍左右
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s******y 发帖数: 28562 | 11 这个就是这样的,你要想漏过去的反而漏不过去。
不想要漏过去的反而会哗哗的漏掉。
而且,这种concentrator 设计的时候不是为了分离蛋白用的,
像你这种用法,会让很多蛋白会卡在孔里或者粘在膜上,不可能全部漏过去的,
能弄到20%已经不错了,但是如果你测一下上方溶液里的蛋白含量,应该会小于80%
【在 a***a 的大作中提到】 : 漏也漏不了多少,我用30k的concentrator试着想分离10k的蛋白(可以想让他 : 漏过去) : 结果发现也就20%能过去。。。
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a***a 发帖数: 40617 | 12 这个本底损失我当然知道
【在 s******y 的大作中提到】 : 这个就是这样的,你要想漏过去的反而漏不过去。 : 不想要漏过去的反而会哗哗的漏掉。 : 而且,这种concentrator 设计的时候不是为了分离蛋白用的, : 像你这种用法,会让很多蛋白会卡在孔里或者粘在膜上,不可能全部漏过去的, : 能弄到20%已经不错了,但是如果你测一下上方溶液里的蛋白含量,应该会小于80%
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m****m 发帖数: 395 | 13 难道就没有一个既好用又省事的浓缩蛋白的方法吗?可以真空抽吗,弄掉些水分就好阿 |
a***a 发帖数: 40617 | 14 很多做nmr的蛋白的确可以这么折腾。很爽
【在 m****m 的大作中提到】 : 难道就没有一个既好用又省事的浓缩蛋白的方法吗?可以真空抽吗,弄掉些水分就好阿
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s******y 发帖数: 28562 | 15 当然可以,真空抽,保持比较低的温度(10度左右就好)
但是,抽完之后溶液里的盐度会很高的,得dialyze 一次。
或者,你一开始就用比较低盐的溶液的溶解蛋白,然后再抽真空。
【在 m****m 的大作中提到】 : 难道就没有一个既好用又省事的浓缩蛋白的方法吗?可以真空抽吗,弄掉些水分就好阿
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m****m 发帖数: 395 | 16 我想把磷脂蛋白抽干些可以放多点样品到ROTOR里,老板还不同意呢,说水分的多少可
能会影响结构功能。。。
【在 a***a 的大作中提到】 : 很多做nmr的蛋白的确可以这么折腾。很爽
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a******g 发帖数: 71 | 17 我印象中Pierce测定他们的concentrator的MWCO是用的BSA,lysozyme,ubiquitin和
cytochrome C。
【在 s******y 的大作中提到】 : 小师弟呵,那个三倍的说法是蛋白生化界人常用的。 : 因为公司们标定那个MWCO 一般是用直链高分子聚合物来测的。 : 换算成球型分子就必须比这个大三倍,才能保证球形分子的直径是孔径的 : 1。5倍左右
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s******y 发帖数: 28562 | 18 不同的公司做法不一样。这个得看他们的产品说明。
【在 a******g 的大作中提到】 : 我印象中Pierce测定他们的concentrator的MWCO是用的BSA,lysozyme,ubiquitin和 : cytochrome C。
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e****s 发帖数: 1125 | 19 你说的就是冷冻干燥啊,冷冻干燥也有保持蛋白活性和保持活性的问题。而且往往要加
入大量的保护剂,BSA之类的。
研究上还是超滤好。而且Sunnyday说的膜孔3倍分子量以下是很对的。
【在 m****m 的大作中提到】 : 难道就没有一个既好用又省事的浓缩蛋白的方法吗?可以真空抽吗,弄掉些水分就好阿
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l**n 发帖数: 109 | 20 37C超声? 蛋白是不是变性了?
【在 m****m 的大作中提到】 : 用饱和硫酸铵沉淀了蛋白,完全去除上清液后,PELLET用BUFFER溶解,先用PIPET轻轻 : 把PELLET打碎成小碎片,然后在37C超声水槽里超声,最后还是有微小的蛋白碎片怎么 : 都不溶解,测了OD280=2左右,也不算很浓啊,这个浓度的时候这个蛋白一般都是溶解 : 的,测了PH也没有问题。请问该如何让蛋白完全溶解阿?
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