h********8 发帖数: 49 | 1 看到网上一个报道,用全基因组测序肿瘤以确定突变类型和疗法的。
大家怎么看个性化医疗在抗癌领域的应用,我觉得要解决以下问题。
1.我以后得某种癌的可能性
2.能不能在早期用biomarker检测出我身上肿瘤,如血液检测circulating tumor cell
3.一旦得癌,我得的是哪一种,肿瘤基因组出现了什么突变,有没有针对性的抗癌药和
临床试验
4.抗癌药的剂量是不是最优
5.治好后或者稳定期,会不会恶化或者重来。
故事原文在这
http://www.caijing.com.cn/2012-09-05/112107241.html
发个精要版
2004
• Beth McDaniel, 61, 癌症症状从全身瘙痒开始。然后, 皮肤变成了猩
红色,开始发生感染
2005
• 被诊断为一种罕见的 T 细胞淋巴瘤,导致白细胞癌变并迁移到皮肤表
面。这是一种不治之症,没有标准疗法,到了她这个阶段的病人平均只能再活几年
2010夏天
• 病情急剧恶化了,数百个肿瘤在皮肤下突然出现,有些足有猕猴桃那么
大,并且开裂了。
• Beth的儿子麦克丹尼尔是分子生物学博士,在基因测序公司 Illumina
任职。他决定离职,全职研究如何使用最先进的基因测序及分析技术来对付母亲的癌症
。麦克丹尼尔博士因工作需要而读过相关科学报道,还参加过相关医学会议并在那里听
过全基因组测序的报告。他注意到,报告中提及的病人似乎都患有罕见癌症。
2011年1-4月
• 在Mayo Clinic,Illumina,TGen的协助下全基因组测序,数据分析,
耗资4.628万美
2012年5月18日
• 研究者们注意到她的癌症细胞里两个基因似乎融合到了一起。结果是,
癌细胞中的细胞生长信号被反转了,就像是线接反了那样。她免疫系统的T细胞也就是
癌细胞每次收到停止信号时,就会像收到增长信号那样增生,而每次收到增长信号时,
反而会停止生长。
• 如果研究组的推理是对的,那么停止她癌细胞生长的办法就是向它发出
生长信号。而一种对抗黑色素瘤的新药ipilimumab(商品名 Yervoy)正是设计用来做这
个的。它能促进正常T细胞的生长。但如果研究人员错了,那么这种药就可能让她死掉。
7 月 28 日
• 接受了第一次注射,效果十分显著,甚至可以每天去餐厅和电影院了。
9 月 2 日,她和丈夫一同去餐馆庆祝他们 50 周年结婚纪念日。
9月末 癌症反弹,
11月30日 去世
为什么失败?
• 05-10技术不成熟。动手太晚?推理错误?抗癌药疗效?用药过度? |
l****m 发帖数: 751 | 2 many people have started to do what you listed.
There are both positive and negative results so far. I guess the main
limitation are: 1. the high cost 2. legal issue. |
c******r 发帖数: 3778 | 3 终于啊,不用转基因可以讨论些有意思的问题了。赞!
你的这个正是现代肿瘤研究的发展方向。
肿瘤有高度的自身选择和进化,导致非常diversified。在基因水平上就是不同肿瘤有
不同的基因改变,病理上同一种肿瘤也有不同的基因改变,即使到同一个人的肿瘤里面
不同的细胞也有不同的改变。因此个性化医疗,或者说对肿瘤的个性化治疗。
看到网上一个报道,用全基因组测序肿瘤以确定突变类型和疗法的。
大家怎么看个性化医疗在抗癌领域的应用,我觉得要解决以下问题。
1.我以后得某种癌的可能性
//在一定程度上yes,完全可以做到。比如angelina jolie,就通过基因检测发现有
很高的乳腺癌几率,所以做了预防性切除。但是除此之外,还有很多散发肿瘤,无法预
测。
2.能不能在早期用biomarker检测出我身上肿瘤,如血液检测circulating tumor cell
//这个一直在做。但是太难了。你想想,全身4升血,取血10ml,有几百万细胞里面
也许只有几个肿瘤细胞。这对检测试剂的灵敏性准确性要求非常非常高。目前手段还不
容易做到。当然随着新技术的发展,还是有可能的。比如有研究用纳米筛来检测癌细胞。
3.一旦得癌,我得的是哪一种,肿瘤基因组出现了什么突变,有没有针对性的抗癌药和
临床试验。
//这基本是目前肿瘤基因研究的重点。比如目前的多数靶向治疗,都要求先检查靶细
胞的存在,表达量等等,来决定是否使用某个靶向药物。
4.抗癌药的剂量是不是最优
//是,理论上是可以的。但是需要庞大数据库,大量的临床数据进行分析。目前肯定
有人在做,但是大概还没有做到。
5.治好后或者稳定期,会不会恶化或者重来。
//预后也是目前肿瘤治疗的中的一个重要问题。确实基因检测在一定程度上比其他预
测更准确。但是跟4一样,需要大量临床数据。目前还做不到非常完善。
故事原文在这
http://www.caijing.com.cn/2012-09-05/112107241.html
发个精要版
2004
• Beth McDaniel, 61, 癌症症状从全身瘙痒开始。然后, 皮肤变成了猩
红色,开始发生感染
2005
• 被诊断为一种罕见的 T 细胞淋巴瘤,导致白细胞癌变并迁移到皮肤表
面。这是一种不治之症,没有标准疗法,到了她这个阶段的病人平均只能再活几年
2010夏天
• 病情急剧恶化了,数百个肿瘤在皮肤下突然出现,有些足有猕猴桃那么
大,并且开裂了。
• Beth的儿子麦克丹尼尔是分子生物学博士,在基因测序公司 Illumina
任职。他决定离职,全职研究如何使用最先进的基因测序及分析技术来对付母亲的癌症
。麦克丹尼尔博士因工作需要而读过相关科学报道,还参加过相关医学会议并在那里听
过全基因组测序的报告。他注意到,报告中提及的病人似乎都患有罕见癌症。
2011年1-4月
• 在Mayo Clinic,Illumina,TGen的协助下全基因组测序,数据分析,
耗资4.628万美
2012年5月18日
• 研究者们注意到她的癌症细胞里两个基因似乎融合到了一起。结果是,
癌细胞中的细胞生长信号被反转了,就像是线接反了那样。她免疫系统的T细胞也就是
癌细胞每次收到停止信号时,就会像收到增长信号那样增生,而每次收到增长信号时,
反而会停止生长。
• 如果研究组的推理是对的,那么停止她癌细胞生长的办法就是向它发出
生长信号。而一种对抗黑色素瘤的新药ipilimumab(商品名 Yervoy)正是设计用来做这
个的。它能促进正常T细胞的生长。但如果研究人员错了,那么这种药就可能让她死掉。
7 月 28 日
• 接受了第一次注射,效果十分显著,甚至可以每天去餐厅和电影院了。
9 月 2 日,她和丈夫一同去餐馆庆祝他们 50 周年结婚纪念日。
9月末 癌症反弹,
11月30日 去世
为什么失败?
• 05-10技术不成熟。动手太晚?推理错误?抗癌药疗效?用药过度?
//原因很明显。就是我前面说的,肿瘤本身是个很diversified system。有各种各样
的变异。检测到的几乎肯定是最多细胞表达的。但是药物杀死这些细胞之后病人获得好
转。但是同时,肿瘤是个evolution system。也就是说,少量的肿瘤细胞不表达或者有
其他手段对药物不敏感的细胞就获得了繁殖空间。因此结果就是迅速反弹。所以靶向(
你这个例子就是一个靶向治疗的例子)治疗一般需要多药联合。由于靶向的特异性太好
了,虽然大大减少了副作用,但是同时也减少了非特异性杀伤肿瘤细胞的能力,给复发
提供了条件。所以将来的方向是:
1。多靶向药物联合使用。
2。反复检查肿瘤细胞,调整靶向药物。
这些手段都在做,但是需要时间。大概有20-30年以后,应该会有比较完整的综合治疗
手段。 |
h********n 发帖数: 4079 | 4 话说刚才我打电话去MD Anderson Cancer Center找一个教授, 正好秘书接, 然我等个3
分钟左右, 我就听到他们自动的语音广告:
In MD Anderson there is no standard therapy, every patient is unique.... |
h******e 发帖数: 1737 | 5 说一点,如果已经存在circulating cancer cell的话好像已经是比较晚期的情况了
感觉如果能有什么突破可以使得早期(stage1,不晚于stage2)检测的灵敏度升高假阳
性率降低都是当前科技医疗条件下肿瘤治疗很重要的突破 |
s*****g 发帖数: 7857 | 6 其实国内很多肺癌就相当于有靶向治疗了.如果是低分化而没有任何能检测到的突变的
癌,就很难有希望治愈. |
d**********t 发帖数: 20415 | 7 血液筛查的重点是biomarker而不是什么circulating cancer cell吧,血液筛查如果能
找到合适的biomarker的话,可行性是最高的,可惜这方面的进展还是非常缓慢
【在 h******e 的大作中提到】 : 说一点,如果已经存在circulating cancer cell的话好像已经是比较晚期的情况了 : 感觉如果能有什么突破可以使得早期(stage1,不晚于stage2)检测的灵敏度升高假阳 : 性率降低都是当前科技医疗条件下肿瘤治疗很重要的突破
|
m*****g 发帖数: 21 | 8 癌细胞的heterogenecity
这个案例第一步已经很成功了,这个儿子真是做得让人敬佩。但是target single
molecule多半会出现这样的结果的。
这其间如果再测序一次,是不是可能会指导新的治疗,但是4万多美元测序成本是不是
还是太高了?印象里全基因测序应该降了很多了。
cell
【在 h********8 的大作中提到】 : 看到网上一个报道,用全基因组测序肿瘤以确定突变类型和疗法的。 : 大家怎么看个性化医疗在抗癌领域的应用,我觉得要解决以下问题。 : 1.我以后得某种癌的可能性 : 2.能不能在早期用biomarker检测出我身上肿瘤,如血液检测circulating tumor cell : 3.一旦得癌,我得的是哪一种,肿瘤基因组出现了什么突变,有没有针对性的抗癌药和 : 临床试验 : 4.抗癌药的剂量是不是最优 : 5.治好后或者稳定期,会不会恶化或者重来。 : 故事原文在这 : http://www.caijing.com.cn/2012-09-05/112107241.html
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Z**********g 发帖数: 222 | |
C********w 发帖数: 1724 | 10 CTC 应该是转移开始发生了, 癌细胞从肿瘤上脱落下来了
【在 h******e 的大作中提到】 : 说一点,如果已经存在circulating cancer cell的话好像已经是比较晚期的情况了 : 感觉如果能有什么突破可以使得早期(stage1,不晚于stage2)检测的灵敏度升高假阳 : 性率降低都是当前科技医疗条件下肿瘤治疗很重要的突破
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C********w 发帖数: 1724 | 11 如果说癌症病人最后能痊愈, 靠的肯定是自身的免疫.
所谓的什么什么疗法都是瞎扯
个3
【在 h********n 的大作中提到】 : 话说刚才我打电话去MD Anderson Cancer Center找一个教授, 正好秘书接, 然我等个3 : 分钟左右, 我就听到他们自动的语音广告: : In MD Anderson there is no standard therapy, every patient is unique....
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D***s 发帖数: 5613 | 12 有意思的报道
cell
【在 h********8 的大作中提到】 : 看到网上一个报道,用全基因组测序肿瘤以确定突变类型和疗法的。 : 大家怎么看个性化医疗在抗癌领域的应用,我觉得要解决以下问题。 : 1.我以后得某种癌的可能性 : 2.能不能在早期用biomarker检测出我身上肿瘤,如血液检测circulating tumor cell : 3.一旦得癌,我得的是哪一种,肿瘤基因组出现了什么突变,有没有针对性的抗癌药和 : 临床试验 : 4.抗癌药的剂量是不是最优 : 5.治好后或者稳定期,会不会恶化或者重来。 : 故事原文在这 : http://www.caijing.com.cn/2012-09-05/112107241.html
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h********8 发帖数: 49 | 13 mashang,你说的对,文章里的确提到了9月末发病后,重新测序了一次
医生们考虑了另一个不那么吸引人的目标:T 细胞用来停止生长的一个突变基因。一些
尚未发表的针对老鼠的实验显示,一种对抗肾癌的药物也许可以停止带有这种突变的T
细胞的增长。
11月26号用药,11月30好病逝。。。从04年发现到2012年,扛了8年,已经回天无力了。
关于测序费用,当时是2011,花了4万多,文章提到2012年测,只用2万多,估计还包括
了数据分析的费用。现在1000美元的测序已经不远了。
http://www.extremetech.com/extreme/151086-minion-a-complete-dna
【在 m*****g 的大作中提到】 : 癌细胞的heterogenecity : 这个案例第一步已经很成功了,这个儿子真是做得让人敬佩。但是target single : molecule多半会出现这样的结果的。 : 这其间如果再测序一次,是不是可能会指导新的治疗,但是4万多美元测序成本是不是 : 还是太高了?印象里全基因测序应该降了很多了。 : : cell
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b****r 发帖数: 17995 | 14 癌症到了后期,癌细胞一般都在疯狂增殖,增殖过程中不断伴有各种类型的染色体丢失
和重组,变化类型越来越多,每一个细胞都有潜力成为新的抗药株的源头,那时候怎么
跟踪靶位都是徒劳的了。应该来说,理论上还是必须靠早期发现,多联用药才有可能治
愈癌症
T
了。
【在 h********8 的大作中提到】 : mashang,你说的对,文章里的确提到了9月末发病后,重新测序了一次 : 医生们考虑了另一个不那么吸引人的目标:T 细胞用来停止生长的一个突变基因。一些 : 尚未发表的针对老鼠的实验显示,一种对抗肾癌的药物也许可以停止带有这种突变的T : 细胞的增长。 : 11月26号用药,11月30好病逝。。。从04年发现到2012年,扛了8年,已经回天无力了。 : 关于测序费用,当时是2011,花了4万多,文章提到2012年测,只用2万多,估计还包括 : 了数据分析的费用。现在1000美元的测序已经不远了。 : http://www.extremetech.com/extreme/151086-minion-a-complete-dna
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w****w 发帖数: 521 | 15 现在whole genome测序$5k应该可以了吧?如果target一两个基因应该不超过$200。 |
a**e 发帖数: 5094 | 16 测序的费用只是治疗费用的一小部分啊。。。剩下的钱从哪里出?
obama care每个人每年的保险费用支出是固定的。个性化医疗也就是super rich玩玩。
中产就该吃吃,该玩玩,洗洗睡个好觉,早死少受罪就行了。
cell
【在 h********8 的大作中提到】 : 看到网上一个报道,用全基因组测序肿瘤以确定突变类型和疗法的。 : 大家怎么看个性化医疗在抗癌领域的应用,我觉得要解决以下问题。 : 1.我以后得某种癌的可能性 : 2.能不能在早期用biomarker检测出我身上肿瘤,如血液检测circulating tumor cell : 3.一旦得癌,我得的是哪一种,肿瘤基因组出现了什么突变,有没有针对性的抗癌药和 : 临床试验 : 4.抗癌药的剂量是不是最优 : 5.治好后或者稳定期,会不会恶化或者重来。 : 故事原文在这 : http://www.caijing.com.cn/2012-09-05/112107241.html
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a********k 发帖数: 2273 | 17 现实情况是在FDA的严格监管下,没有$200测不了一个exon。即使仪器+试剂0费用,大
部分断实验室做一次测序需要$100才保本。
【在 w****w 的大作中提到】 : 现在whole genome测序$5k应该可以了吧?如果target一两个基因应该不超过$200。
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c***r 发帖数: 1132 | 18 英国不是有个女的,把肿瘤咳出来了,不治而愈。都是命啊
【在 C********w 的大作中提到】 : 如果说癌症病人最后能痊愈, 靠的肯定是自身的免疫. : 所谓的什么什么疗法都是瞎扯 : : 个3
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t**********n 发帖数: 283 | 19 Good post.
【在 c******r 的大作中提到】 : 终于啊,不用转基因可以讨论些有意思的问题了。赞! : 你的这个正是现代肿瘤研究的发展方向。 : 肿瘤有高度的自身选择和进化,导致非常diversified。在基因水平上就是不同肿瘤有 : 不同的基因改变,病理上同一种肿瘤也有不同的基因改变,即使到同一个人的肿瘤里面 : 不同的细胞也有不同的改变。因此个性化医疗,或者说对肿瘤的个性化治疗。 : 看到网上一个报道,用全基因组测序肿瘤以确定突变类型和疗法的。 : 大家怎么看个性化医疗在抗癌领域的应用,我觉得要解决以下问题。 : 1.我以后得某种癌的可能性 : //在一定程度上yes,完全可以做到。比如angelina jolie,就通过基因检测发现有 : 很高的乳腺癌几率,所以做了预防性切除。但是除此之外,还有很多散发肿瘤,无法预
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t**********n 发帖数: 283 | 20 RE
1)早发现
2)先用个性化药物搞掉大块肿瘤
3)免疫疗法激活免疫体系消除剩下的零星肿瘤细胞
这个想法如何?
【在 b****r 的大作中提到】 : 癌症到了后期,癌细胞一般都在疯狂增殖,增殖过程中不断伴有各种类型的染色体丢失 : 和重组,变化类型越来越多,每一个细胞都有潜力成为新的抗药株的源头,那时候怎么 : 跟踪靶位都是徒劳的了。应该来说,理论上还是必须靠早期发现,多联用药才有可能治 : 愈癌症 : : T : 了。
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T******y 发帖数: 14506 | |
b****r 发帖数: 17995 | 22 FDA 还基本没有kick in呢。不过马上就要全面开始了,据说很麻烦
现在主要是CAP 和CLIA,加上各个地方的政策
【在 a********k 的大作中提到】 : 现实情况是在FDA的严格监管下,没有$200测不了一个exon。即使仪器+试剂0费用,大 : 部分断实验室做一次测序需要$100才保本。
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a********k 发帖数: 2273 | 23 主要是现在的commissioner Margaret Hamburg推,犹太和黑女加上诊断公司的高层背
景,政治力量太强。可以预计FDA马上要全面介入,除了涨价别无他法。IVD的东西贵死。
【在 b****r 的大作中提到】 : FDA 还基本没有kick in呢。不过马上就要全面开始了,据说很麻烦 : 现在主要是CAP 和CLIA,加上各个地方的政策
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n******7 发帖数: 12463 | 24 我觉得这个要通过sequencing技术早期发现,是不是有个采样的问题?
比如长在肝部的,你不取到对应位置的样本,还是发现不了啊
等能通过血液发现了,应该都扩散了吧
我觉得得用nano机器人采样才行吧?
或者nano测序仪,体内等间距布置,实时监控,健康sensor |
n******7 发帖数: 12463 | 25 对这个不懂
这是什么原理?
【在 a********k 的大作中提到】 : 现实情况是在FDA的严格监管下,没有$200测不了一个exon。即使仪器+试剂0费用,大 : 部分断实验室做一次测序需要$100才保本。
|
e*****i 发帖数: 149 | 26 我恰好看过一篇review,CCC是在癌症早期都可以有的,哪怕用现有手段都检查不到的
时候,CCC都已经有了。
【在 h******e 的大作中提到】 : 说一点,如果已经存在circulating cancer cell的话好像已经是比较晚期的情况了 : 感觉如果能有什么突破可以使得早期(stage1,不晚于stage2)检测的灵敏度升高假阳 : 性率降低都是当前科技医疗条件下肿瘤治疗很重要的突破
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n******7 发帖数: 12463 | 27 可以给个link吗
非常有兴趣
【在 e*****i 的大作中提到】 : 我恰好看过一篇review,CCC是在癌症早期都可以有的,哪怕用现有手段都检查不到的 : 时候,CCC都已经有了。
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