g******o 发帖数: 96 | 1 target protein可以被上游kinase磷酸化。serine突变成aspartic acid有表型,可是
serine突变成alanine没有表型。reviewer认为这个位点在正常生理情况下不怎么重要
,并要求解释原因。我的解释是这个位点在in vivo 被高度调控,可能有phosphate不
停的去磷酸化;也可能只有在特定的条件下才被磷酸化。
有人知道有这样的例子吗?只有D mutation 有表型而A mutation 没有表型的。
谢谢! |
l****y 发帖数: 398 | 2 这种情况不少, 蛋白一般不是被完全被磷酸化的,大概10-20%吧, SD mutant放大了
磷酸化的效应,所以reviewer是有道理的; 你的解释也很有道理,再来点redundancy,
secondary sites...
reviewer买不买就只有听天由命了。
【在 g******o 的大作中提到】 : target protein可以被上游kinase磷酸化。serine突变成aspartic acid有表型,可是 : serine突变成alanine没有表型。reviewer认为这个位点在正常生理情况下不怎么重要 : ,并要求解释原因。我的解释是这个位点在in vivo 被高度调控,可能有phosphate不 : 停的去磷酸化;也可能只有在特定的条件下才被磷酸化。 : 有人知道有这样的例子吗?只有D mutation 有表型而A mutation 没有表型的。 : 谢谢!
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g******o 发帖数: 96 | 3 多谢回复!in vivo磷酸化比例确实很小,也有别的位点影响。不过只有这个site S-D
表型最强。能给个具体例子吗? |
e****s 发帖数: 1125 | 4 不知道是我没理解对,还是怎样。
根据你说的,D Mutant有表型,A Mutant没有,不恰恰表示Ser是一个重要的磷酸化位
点吗?D模拟该底物磷酸化以后的状态。
不知道所谓正常生理情况下不怎么重要的依据是什么?不知道Reviewer凭什么这样认为
的。
【在 g******o 的大作中提到】 : target protein可以被上游kinase磷酸化。serine突变成aspartic acid有表型,可是 : serine突变成alanine没有表型。reviewer认为这个位点在正常生理情况下不怎么重要 : ,并要求解释原因。我的解释是这个位点在in vivo 被高度调控,可能有phosphate不 : 停的去磷酸化;也可能只有在特定的条件下才被磷酸化。 : 有人知道有这样的例子吗?只有D mutation 有表型而A mutation 没有表型的。 : 谢谢!
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g******o 发帖数: 96 | 5 这个protein S-D 蛋白变的stable,降解慢。按道理来讲S-A应该降解的快才对,可是
和wt没什么区别。 互补实验也是这样D mutation有表型,A mutation和wt一样。 |
s********r 发帖数: 312 | 6 是蛋白质本身biochemistry的表型,还是建立的细胞系这种情况下的表型?n n[发自未
名空间iPhone版] |
g******o 发帖数: 96 | 7 biochemistry和细胞系(KO cell line rescue)都是一样的,只有D有表型。 |
s********r 发帖数: 312 | 8 可能跟p53一样,phosphorylation对activity影响不大,只影响stability n[发自未名
空间iPhone版] |
p*****c 发帖数: 116 | 9 跟你用的细胞株有关,有些肿瘤细胞内kinase活性超强,WT transfection其实自动被
磷酸化变成D mut状态。 |
p*****e 发帖数: 93 | 10 可能表达量太高了,所以S-A 没表型。
【在 g******o 的大作中提到】 : target protein可以被上游kinase磷酸化。serine突变成aspartic acid有表型,可是 : serine突变成alanine没有表型。reviewer认为这个位点在正常生理情况下不怎么重要 : ,并要求解释原因。我的解释是这个位点在in vivo 被高度调控,可能有phosphate不 : 停的去磷酸化;也可能只有在特定的条件下才被磷酸化。 : 有人知道有这样的例子吗?只有D mutation 有表型而A mutation 没有表型的。 : 谢谢!
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